Plastid Envelope-Localized Proteins Exhibit a Stochastic Spatiotemporal Relationship to Stromules
Notice bibliographique
Résumé
Plastids in the viridiplantae sporadically form thin tubules called stromules that increase the interactive surface between the plastid and the surrounding cytoplasm. Several recent publications that report observations of certain proteins localizing to the extensions have then used the observations to suggest stromule-specific functions. The mechanisms by which specific localizations on these transient and sporadically formed extensions might occur remain unclear. Previous studies have yet to address the spatiotemporal relationship between a particular protein localization pattern and its distribution on an extended stromules and / or the plastid body. Here, we have used discrete protein patches found in several transgenic plants as fiducial markers to investigate this relationship. While we consider the inner plastid envelope-membrane localized protein patches of the GLUCOSE 6-PHOSPHATE / PHOSPHATE TRANSLOCATOR1 and the TRIOSE-PHOSPHATE/ PHOSPHATE TRANSLOCATOR 1 as artefacts of fluorescent fusion protein over-expression, stromule formation is not compromised in the respective stable transgenic lines that maintain normal growth and development. Our analysis of chloroplasts in the transgenic lines in the Arabidopsis Columbia background, and in the arc6 mutant, under stromule-inducing conditions shows that the possibility of finding a particular protein-enriched domain on an extended stromule or on a region of the main plastid body is stochastic. Our observations provide insights on the behaviour of chloroplasts, the relationship between stromules and the plastid-body and strongly challenge claims of stromule-specific functions based solely upon protein localization to plastid extensions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».