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Enregistrement W2805634366 · doi:10.1038/s41598-018-23930-1

Real-time Detection and Monitoring of Loop Mediated Amplification (LAMP) Reaction Using Self-quenching and De-quenching Fluorogenic Probes

2018· article· en· W2805634366 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLoop-mediated isothermal amplificationDetection limitQuenching (fluorescence)AmpliconChemistryPrimer (cosmetics)FluorescenceAnalyteChromatographyPolymerase chain reactionDNAOpticsBiochemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is an isothermal nucleic acid amplification (iNAAT) technique known for its simplicity, sensitivity and speed. Its low-cost feature has resulted in its wide scale application, especially in low resource settings. The major disadvantage of LAMP is its heavy reliance on indirect detection methods like turbidity and non-specific dyes, which often leads to the detection of false positive results. In the present work, we have developed a direct detection approach, whereby a labelled loop probe quenched in its unbound state, fluoresces only when bound to its target (amplicon). Henceforth, referred to as Fluorescence of Loop Primer Upon Self Dequenching-LAMP (FLOS-LAMP), it allows for the sequence-specific detection of LAMP amplicons. The FLOS-LAMP concept was validated for rapid detection of the human pathogen, Varicella-zoster virus, from clinical samples. The FLOS-LAMP had a limit of detection of 500 copies of the target with a clinical sensitivity and specificity of 96.8% and 100%, respectively. The high level of specificity is a major advance and solves one of the main shortcomings of the LAMP technology, i.e. false positives. Self-quenching/de-quenching probes were further used with other LAMP primer sets and different fluorophores, thereby demonstrating its versatility and adaptability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil0,483

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle