MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2805655643 · doi:10.1021/acssensors.8b00165

Capture and Translocation Characteristics of Short Branched DNA Labels in Solid-State Nanopores

2018· article· en· W2805655643 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueACS Sensors · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueNanopore and Nanochannel Transport Studies
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Research, Innovation and Science
Mots-clésNanoporeDNAMoleculeIonic bondingBiophysicsDwell timeChemistryNanopore sequencingNanotechnologyMembraneBiosensorChromosomal translocationMaterials scienceCrystallographyDNA sequencingIonBiochemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The challenge when employing solid-state nanopores as single-molecule sensors in a given assay is the specificity of the ionic current signal during the translocation of target molecules. Here we present the capture and translocation characteristics of short structurally defined DNA molecules that could serve as effective surrogate labels in biosensing applications. We produced T-shaped or Y-shaped DNA molecules with a 50 bp double-stranded DNA (dsDNA) backbone and a 25 bp dsDNA branch in the middle, as improved labels over short linear DNA fragments. We show that molecular topologies can be distinguished from linear DNA by analyzing ionic current blockades produced as these DNA labels translocate through nanopores fabricated by controlled breakdown on 10-nm-thick SiN membranes and ranging in diameter from 4 to 10 nm. Event signatures are shown to be a direct result of the structure of the label and lead to an increased signal-to-noise ratio over that of short linear dsDNA, in addition to well resolved dwell times for the pore size in this range. These results show that structurally defined branched DNA molecules can be robustly detected for a broad range of pore size, and thus represent promising candidates as surrogate labels in a variety of nanopore-based molecular or immunoassay schemes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,563

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle