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Enregistrement W2805769668 · doi:10.1136/gutjnl-2017-314472.63

OC-063 Gut microbiota-host bile acid metabolism interactions in clostridium difficile infection: the explanation for the efficacy of faecal microbiota transplantation?

2017· article· en· W2805769668 sur OpenAlexaff
Benjamin H. Mullish, J McDonald, DH Kao, JR Allegretti, EO Petrof, Alexandros Pechlivanis, G. R. Barker, SR Atkinson, Mark Thursz, JR Marchesi

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDeoxycholic acidTaurocholic acidBile acidMicrobiologyBiologyGut floraBacteriaMicrobiomeBiochemistryBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Faecal microbiota transplantation (FMT) effectively treats recurrent Clostridium difficile infection (CDI), yet the mechanisms underlying its efficacy are poorly-defined. In vitro, conjugated primary bile salts (i.e. taurocholic acid) promote the germination of C. difficile, whilst secondary bile salts (i.e. deoxycholic acid) inhibit vegetative growth of the organism. As gut microbiota-derived enzymes (i.e. bile salt hydrolases (BSH)) are responsible for bile acid metabolism in vivo, we hypothesised that the efficacy of FMT may reflect transfer of BSH-producing bacteria, with restoration of a gut bile acid profile that inhibit germination/vegetative growth of C. difficile. Method Faecal samples were collected from patients with recurrent CDI pre-FMT (n=26), at 8–12 weeks after successful FMT, and also from stool donors (n=17). Bacterial DNA was used for microbial profiling (via 16S rRNA gene sequencing) and for qPCR of BSH genes. Liquid chromatography-mass spectrometry was used for bile acid profiling. BSH enzyme activity was established using a plate-based precipitation assay. Results Microbial and bile acid profiles from pre-FMT patients were markedly different to those found in the post-FMT and donor groups (p<0.001, PERMANOVA); qPCR confirmed enrichment of BSH-producing organisms post-FMT. Taurocholic acid levels were elevated (and deoxycholic acid levels reduced) pre-FMT compared to donors and post-FMT (p<0.001, Wilcoxon-Mann-Whitney test). By Spearman’s rank, abundance of BSH-producing bacteria negatively correlated with taurocholic acid and positively correlated with deoxycholic acid levels (Figure 1), with p<0.05 for this correlation for levels of both bile acids with Bacteroides vulgatus, Blautia obeum, Dorea longicatena, and Eubacterium rectale. Stool BSH activity was negligible pre-FMT, but was significantly increased post-FMT (p<0.002, Wilcoxon-Mann-Whitney). Conclusion The gut microbiota is enriched with BSH-producing bacterial species post-FMT for CDI, and these organisms are present within the gut microbiota of donors. The increased relative abundance of BSH-producing organisms post-FMT was negatively correlated with gut taurocholic acid levels, positively correlated with deoxycholic acid levels, and associated with increased BSH activity. These data collectively support a hypothesis of transfer of BSH-producing organisms during FMT linked to reconstitution of a gut bile acid profile unfavourable to the germination and growth of C. difficile. Disclosure of Interest None Declared

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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