Genotypes and phenotypes of resistance in Ecuadorian Plasmodium falciparum
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Malaria continues to be endemic in the coast and Amazon regions of Ecuador. Clarifying current Plasmodium falciparum resistance in the country will support malaria elimination efforts. In this study, Ecuadorian P. falciparum parasites were analysed to determine their drug resistance genotypes and phenotypes. METHODS: Molecular analyses were performed to search for mutations in known resistance markers (Pfcrt, Pfdhfr, Pfdhps, Pfmdr1, k13). Pfmdr1 copy number was determined by qPCR. PFMDR1 transporter activity was characterized in live parasites using live cell imaging in combination with the Fluo-4 transport assay. Chloroquine, quinine, lumefantrine, mefloquine, dihydroartemisinin, and artemether sensitivities were measured by in vitro assays. RESULTS: The majority of samples from this study presented the CVMNT genotype for Pfcrt (72-26), NEDF SDFD mutations in Pfmdr1 and wild type genotypes for Pfdhfr, Pfdhps and k13. The Ecuadorian P. falciparum strain ESM-2013 showed in vitro resistance to chloroquine, but sensitivity to quinine, lumefantrine, mefloquine, dihydroartemisinin and artemether. In addition, transport of the fluorochrome Fluo-4 from the cytosol into the digestive vacuole (DV) of the ESM-2013 strain was minimally detected in the DV. All analysed samples revealed one copy of Pfmdr1. CONCLUSION: This study indicates that Ecuadorian parasites presented the genotype and phenotype for chloroquine resistance and were found to be sensitive to SP, artemether-lumefantrine, quinine, mefloquine, and dihydroartemisinin. The results suggest that the current malaria treatment employed in the country remains effective. This study clarifies the status of anti-malarial resistance in Ecuador and informs the P. falciparum elimination campaigns in the country.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».