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Enregistrement W2805997543 · doi:10.1038/s41598-018-22328-3

Recombinant RNA-Dependent RNA Polymerase Complex of Ebola Virus

2018· article· en· W2805997543 sur OpenAlexafffund
Egor P. Tchesnokov, Parisa Raeisimakiani, Marianne Ngure, David Marchant, Matthias Götte

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVirologyRNA-dependent RNA polymerasePolymeraseVP40BiologyRNARecombinant DNARNA polymeraseEbola virusNucleotideEnzymeMolecular biologyVirusChemistryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Here we report on the expression, purification and characterization of recombinant ebola virus RNA-dependent RNA polymerase (EBOV RdRp). Active protein complexes composed of the large L protein and viral protein VP35 were isolated from insect cells and analyzed using a short primer/template substrate that allowed benchmarking against related enzymes. RNA synthesis by multiprotein complexes of EBOV, influenza B, respiratory syncytial virus (RSV) and monomeric enzymes of hepatitis C and Zika (ZIKV) viruses required a 5′-phosporylated primer. The minimum length of the primer varied between two and three nucleotides in this system. The EBOV enzyme utilizes Mg 2+ as a co-factor and the D742A substitution provides an active site mutant that likely affects binding of the catalytic metal ions. Selectivity measurements with nucleotide analogues translate our assay into quantitative terms and facilitate drug discovery efforts. The related EBOV and RSV enzymes are not able to efficiently discriminate against ara-cytidine-5′-triphosphate. We demonstrate that this compound acts like a non-obligate chain-terminator.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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