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Enregistrement W2806018846 · doi:10.1111/ajt.14951

Identification of risk epitope mismatches associated with de novo donor-specific HLA antibody development in cardiothoracic transplantation

2018· article· en· W2806018846 sur OpenAlexaff
Jennifer A. McCaughan, Richard Battle, Sunita Singh, Jussi Tikkanen, Yasbanoo Moayedi, Heather J. Ross, L.G. Singer, Shaf Keshavjee, Kathryn Tinckam

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Transplantation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHuman leukocyte antigenEpitopeImmunogenicityTransplantationImmunologyAntibodyLung transplantationHistocompatibility TestingInternal medicineAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The development of de novo donor-specific HLA antibodies (dnDSA) after transplantation is associated with graft failure, mortality, and cost. There is no effective therapeutic intervention to prevent dnDSA or ameliorate associated injury. The aims of this study were to identify specific HLA factors associated with dnDSA development and to propose primary prevention strategies that could reduce the incidence of dnDSA without prohibitively limiting access to transplant. The investigation cohort included heart transplant recipients from 2008 to 2015 (n = 265). HLA typing was performed and HLA antibody testing was undertaken before and after transplantation. HLAMatchmaker analysis was performed for persistent dnDSA to identify potentially more immunogenic eplet differences. Validation was performed in recipients of lung transplants from 2008 to 2013 (n = 433). The majority of recipients with dnDSA had antibodies to identical eplet positions on DQ2 and DQ7. A high-risk epitope mismatch (found in DQA1*05 + DQB1*02/DQB1*03:01(7)) was associated with a 4.2- and 4.9-fold increased risk of dnDSA in heart and lung recipients respectively. HLA electrostatic potential modeling provided a plausible explanation for this observed immunogenicity. A theoretical allocation algorithm avoiding high-risk epitope mismatches was generated and predicted to reduce dnDSA by up to 72% without additional testing, eplet analysis, or cost.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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