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Enregistrement W2806165623 · doi:10.18632/oncotarget.25525

Metabolite profiling identifies a signature of tumorigenicity in hepatocellular carcinoma

2018· article· en· W2806165623 sur OpenAlexaffabout
Shamir Cassim, Valérie‐Ann Raymond, Benoit Lacoste, Pascal Lapierre, Marc Bilodeau

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycolysisCancer researchHepatocellular carcinomaMetaboliteAnaerobic glycolysisBiologyMetabolomeMetabolomicsCancer cellHypoxia (environmental)EndocrinologyInternal medicineMedicineCancerMetabolismChemistryBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Shamir Cassim 1 , Valérie-Ann Raymond 1 , Benoit Lacoste 1 , Pascal Lapierre 1, 2 and Marc Bilodeau 1, 2 1 Laboratoire d’hépatologie cellulaire, Centre de recherche du Centre hospitalier de l'Université de Montréal (CRCHUM), Montréal, QC, Canada 2 Département de médecine, Université de Montréal, Montréal, QC, Canada Correspondence to: Marc Bilodeau, email: marc.bilodeau@umontreal.ca Keywords: liver; hepatocellular carcinoma; glucose; tumorigenicity; metabolic signature Received: March 26, 2018      Accepted: May 17, 2018      Published: June 01, 2018 ABSTRACT HCC (Hepatocellular carcinoma) cells exhibit greater metabolic plasticity than normal hepatocytes since they must survive in a dynamic microenvironment where nutrients and oxygen are often scarce. Using a metabolomic approach combined with functional in vitro and in vivo assays, we aimed to identify an HCC metabolic signature associated with increased tumorigenicity and patient mortality. Metabolite profiling of HCC Dt81Hepa1-6 cells revealed that their increased tumorigenicity was associated with elevated levels of glycolytic metabolites. Tumorigenic Dt81Hepa1-6 also had an increased ability to uptake glucose leading to a higher glycolytic flux that stemmed from an increased expression of glucose transporter GLUT-1. Dt81Hepa1-6-derived tumors displayed increased mRNA expressions of glycolytic genes, Hypoxia-inducible factor-1alpha and of Cyclin D1 . HCC tumors also displayed increased energy charge, reduced antioxidative metabolites and similar fatty acid biosynthesis compared to healthy liver. Increased tumoral expression of glycolytic and hypoxia signaling pathway mRNAs was associated with decreased survival in HCC patients. In conclusion, HCC cells can rapidly alter their metabolism according to their environment and switch to the use of glucose through aerobic glycolysis to sustain their tumorigenicity and proliferative ability. Therefore, cancer metabolic reprogramming could be essential for the tumorigenicity of HCC cells during cancer initiation and invasion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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