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Enregistrement W2806410258 · doi:10.1159/000488759

Cytoplasmic RNA Granules in Somatic Maintenance

2018· review· en· W2806410258 sur OpenAlexafffund
Ossama Moujaber, Ursula Stochaj

Notice bibliographique

RevueGerontology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University Health Centre
Mots-clésRNAStress granuleCytoplasmBiologyCell biologySomatic cellP-bodiesNeurodegenerationExoribonucleaseRNA silencingMessenger RNARNA-binding proteinExosome complexRNA interferenceNon-coding RNATranslation (biology)BiochemistryGeneRNase PDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytoplasmic RNA granules represent subcellular compartments that are enriched in protein-bound RNA species. RNA granules are produced by evolutionary divergent eukaryotes, including yeast, mammals, and plants. The functions of cytoplasmic RNA granules differ widely. They are dictated by the cell type and physiological state, which in turn is determined by intrinsic cell properties and environmental factors. RNA granules provide diverse cellular functions. However, all of the granules contribute to aspects of RNA metabolism. This is exemplified by transcription, RNA storage, silencing, and degradation, as well as mRNP remodeling and regulated translation. Several forms of cytoplasmic mRNA granules are linked to normal physiological processes. For instance, they may coordinate protein synthesis and thereby serve as posttranscriptional "operons". RNA granules also participate in cytoplasmic mRNA trafficking, a process particularly well understood for neurons. Many forms of RNA granules support the preservation of somatic cell performance under normal and stress conditions. On the other hand, severe insults or disease can cause the formation and persistence of RNA granules that contribute to cellular dysfunction, especially in the nervous system. Neurodegeneration and many other diseases linked to RNA granules are associated with aging. Nevertheless, information related to the impact of aging on the various types of RNA granules is presently very limited. This review concentrates on cytoplasmic RNA granules and their role in somatic cell maintenance. We summarize the current knowledge on different types of RNA granules in the cytoplasm, their assembly and function under normal, stress, or disease conditions. Specifically, we discuss processing bodies, neuronal granules, stress granules, and other less characterized cytoplasmic RNA granules. Our focus is primarily on mammalian and yeast models, because they have been critical to unravel the physiological role of various RNA granules. RNA granules in plants and pathogens are briefly described. We conclude our viewpoint by summarizing the emerging concepts for RNA granule biology and the open questions that need to be addressed in future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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