Lactobacilli Are Prominent Members of the Microbiota Involved in the Ruminal Digestion of Barley and Corn
Notice bibliographique
Résumé
The chemical composition of barley grain can vary among barley varieties and result in different digestion efficiencies in the rumen. It is not known if compositional differences in barley can affect the microbiome involved the ruminal digestion of barley. The objective of this study was to characterize the in situ rumen digestion and microbiome of four barley grain varieties. Three ruminally-cannulated heifers were fed a low (60% barley silage, 37 % barley grain and 3% supplement) or high grain (37% barley silage, 60% barley grain and 3% supplement) diets. Four different barley varieties (Fibar, Xena, McGwire and Hilose) and corn as a comparison were included in the experiment. One set of bags was used to estimate dry matter (DM), starch and crude protein (CP) disappearance. A second set was used to extract DNA from the adherent microbiome and a third set was used to visualize grain after incubation using scanning electron microscopy (SEM). DNA was subjected to amplicon 16S rRNA gene sequencing followed by analysis using QIIME. In the low grain diet, McGwire had the highest effective degradability (ED) of DM (P<0.01). The ED of starch was highest (P<0.01) for Fibar, McGwire and Xena, but the ED of CP was not affected by variety. For the high grain diet, Xena and McGwire had the highest ED of DM (P<0.01). The ED of starch was highest (P<0.01) for Xena and Fibar. The ED of protein was highest (P<0.01) for Xena and McGwire. Although the microbiome did not differ between barley varieties, they did differ from corn and with incubation time. Lactobacilli were dominant members of the mature biofilms associated with corn and barley and were accompanied by a notable increase in the lactic acid utilizing genera, Megasphaera. As none of the cattle exhibited subclinical or clinical acidosis during the study, our results suggest that lactobacilli play a more prominent role in routine starch digestion than presently surmised.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».