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Enregistrement W2806468264 · doi:10.3389/fmicb.2018.00718

Lactobacilli Are Prominent Members of the Microbiota Involved in the Ruminal Digestion of Barley and Corn

2018· article· en· W2806468264 sur OpenAlexafffund
Hee Eun Yang, Claiton André Zotti, J. J. McKinnon, Tim A. McAllister

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésRumenStarchDigestion (alchemy)BiologySilageFood scienceMicrobiomeDry matterComposition (language)AgronomyAnimal scienceChemistryFermentation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The chemical composition of barley grain can vary among barley varieties and result in different digestion efficiencies in the rumen. It is not known if compositional differences in barley can affect the microbiome involved the ruminal digestion of barley. The objective of this study was to characterize the in situ rumen digestion and microbiome of four barley grain varieties. Three ruminally-cannulated heifers were fed a low (60% barley silage, 37 % barley grain and 3% supplement) or high grain (37% barley silage, 60% barley grain and 3% supplement) diets. Four different barley varieties (Fibar, Xena, McGwire and Hilose) and corn as a comparison were included in the experiment. One set of bags was used to estimate dry matter (DM), starch and crude protein (CP) disappearance. A second set was used to extract DNA from the adherent microbiome and a third set was used to visualize grain after incubation using scanning electron microscopy (SEM). DNA was subjected to amplicon 16S rRNA gene sequencing followed by analysis using QIIME. In the low grain diet, McGwire had the highest effective degradability (ED) of DM (P<0.01). The ED of starch was highest (P<0.01) for Fibar, McGwire and Xena, but the ED of CP was not affected by variety. For the high grain diet, Xena and McGwire had the highest ED of DM (P<0.01). The ED of starch was highest (P<0.01) for Xena and Fibar. The ED of protein was highest (P<0.01) for Xena and McGwire. Although the microbiome did not differ between barley varieties, they did differ from corn and with incubation time. Lactobacilli were dominant members of the mature biofilms associated with corn and barley and were accompanied by a notable increase in the lactic acid utilizing genera, Megasphaera. As none of the cattle exhibited subclinical or clinical acidosis during the study, our results suggest that lactobacilli play a more prominent role in routine starch digestion than presently surmised.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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