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Enregistrement W2806551209 · doi:10.1186/s13223-018-0259-4

Histone modifications and their role in epigenetics of atopy and allergic diseases

2018· review· en· W2806551209 sur OpenAlexvenueno aff
Bilal Alashkar Alhamwe, Razi Khalaila, J. Wolf, Verena von Bülow, Hani Harb, Fahd Alhamdan, Charles S. Hii, Susan L. Prescott, Antonio Ferrante, Harald Renz, Holger Garn, Daniel P. Potaczek

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilDeutsches Zentrum für LungenforschungDeutscher Akademischer AustauschdienstVon-Behring-Röntgen-Stiftung
Mots-clésEpigeneticsHistoneHistone methylationEpigenomicsHistone codeHistone methyltransferaseCancer epigeneticsBiologyDNA methylationCancer researchCell biologyGeneticsNucleosomeDNAGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This review covers basic aspects of histone modification and the role of posttranslational histone modifications in the development of allergic diseases, including the immune mechanisms underlying this development. Together with DNA methylation, histone modifications (including histone acetylation, methylation, phosphorylation, ubiquitination, etc.) represent the classical epigenetic mechanisms. However, much less attention has been given to histone modifications than to DNA methylation in the context of allergy. A systematic review of the literature was undertaken to provide an unbiased and comprehensive update on the involvement of histone modifications in allergy and the mechanisms underlying this development. In addition to covering the growing interest in the contribution of histone modifications in regulating the development of allergic diseases, this review summarizes some of the evidence supporting this contribution. There are at least two levels at which the role of histone modifications is manifested. One is the regulation of cells that contribute to the allergic inflammation (T cells and macrophages) and those that participate in airway remodeling [(myo-) fibroblasts]. The other is the direct association between histone modifications and allergic phenotypes. Inhibitors of histone-modifying enzymes may potentially be used as anti-allergic drugs. Furthermore, epigenetic patterns may provide novel tools in the diagnosis of allergic disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations261
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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