MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2806646997 · doi:10.1101/340315

<i>Candida albicans</i> hyphal expansion causes phagosomal membrane damage and luminal alkalinization

2018· preprint· en· W2806646997 sur OpenAlexaff
Johannes Westman, Gary P. Moran, Selene Mogavero, Bernhard Hube, Sergio Grinstein

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHyphaPhagosomeCandida albicansMicrobiologyBiologyYeastVacuoleCorpus albicansCell biologyBiochemistryPhagocytosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Macrophages rely on phagosomal acidity to destroy engulfed microorganisms. To survive this hostile response, opportunistic fungi such as Candida albicans developed strategies to evade the acidic environment. C. albicans is polymorphic, able to convert from yeast to hyphae, and this transition is required to subvert the microbicidal activity of the phagosome. However, the phagosomal lumen, which is acidic and nutrient-deprived, inhibits yeast-to-hypha transition. To account for this apparent paradox, it was recently proposed that C. albicans produces ammonia that alkalinizes the phagosome, thus facilitating yeast-to-hypha transformation. We re-examined the mechanism underlying phagosomal alkalinization by applying dual-wavelength ratiometric pH measurements. The phagosomal membrane was found to be highly permeable to ammonia, which is therefore unlikely to account for the pH elevation. Instead, we find that yeast-to-hypha transition begins within acidic phagosomes, and that alkalinization is a consequence of proton leakage induced by excessive membrane distension caused by the expanding hypha. IMPORTANCE C. albicans is the most common nosocomial fungal infection, and over three million people acquire life-threatening invasive fungal infections every year. Even if antifungal drugs exist, almost half of these patients will die. Despite this, fungi remain underestimated as pathogens. Our study uses quantitative biophysical approaches to demonstrate that the yeast-to-hypha transition occurs within the nutrient deprived, acidic phagosome and that alkalinization is a consequence, as opposed to the cause of hyphal growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetAntifungal resistance and susceptibility→Travaux en français237 207→