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Enregistrement W2806912433 · doi:10.1038/s41598-018-22872-y

Diversity of innate immune cell subsets across spatial and temporal scales in an EAE mouse model

2018· article· en· W2806912433 sur OpenAlexaff
Céline Caravagna, Alexandre Jaouën, Sophie Desplat‐Jégo, Keith K. Fenrich, Elise Bergot, Hervé Luche, Pierre Grenot, Geneviève Rougon, Marie Malissen, Franck Debarbieux

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsHorizon 2020 Framework ProgrammeInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCentre National de la Recherche ScientifiqueEuropean CommissionAgence Nationale de la RechercheFondation pour l'Aide à la Recherche sur la Sclérose en Plaques
Mots-clésMicrogliaBiologyExperimental autoimmune encephalomyelitisCD11cImmune systemParenchymaCell biologyImmunologyFlow cytometryInnate immune systemPhenotypeInfiltration (HVAC)Inflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In both multiple sclerosis and its model experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE), the extent of resident microglia activation and infiltration of monocyte-derived cells to the CNS is positively correlated to tissue damage. To address the phenotype characterization of different cell subsets, their spatio-temporal distributions and contributions to disease development we induced EAE in Thy1-CFP//LysM-EGFP//CD11c-EYFP reporter mice. We combined high content flow cytometry, immunofluorescence and two-photon imaging in live mice and identified a stepwise program of inflammatory cells accumulation. First on day 10 after induction, EGFP+ neutrophils and monocytes invade the spinal cord parenchyma through the meninges rather than by extravasion. This event occurs just before axonal losses in the white matter. Once in the parenchyma, monocytes mature into EGFP+/EYFP+ monocyte-derived dendritic cells (moDCs) whose density is maximal on day 17 when the axonal degradation and clinical signs stabilize. Meanwhile, microglia is progressively activated in the grey matter and subsequently recruited to plaques to phagocyte axon debris. LysM-EGFP//CD11c-EYFP mice appear as a powerful tool to differentiate moDCs from macrophages and to study the dynamics of immune cell maturation and phenotypic evolution in EAE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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