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Enregistrement W2806977832 · doi:10.1016/j.ebiom.2018.05.027

Comprehending a Killer: The Akt/mTOR Signaling Pathways Are Temporally High-Jacked by the Highly Pathogenic 1918 Influenza Virus

2018· article· en· W2806977832 sur OpenAlexafffund
Charlene Ranadheera, Kevin M. Coombs, Darwyn Kobasa

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensResearch ManitobaChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of ManitobaPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchPublic Health Agency of Canada
Mots-clésPI3K/AKT/mTOR pathwayBiologyProtein kinase BInfluenza A virusPhosphorylationViral replicationVirusMechanistic target of rapamycinTranscriptomemTORC1Signal transductionCell biologyVirologyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous transcriptomic analyses suggested that the 1918 influenza A virus (IAV1918), one of the most devastating pandemic viruses of the 20th century, induces a dysfunctional cytokine storm and affects other innate immune response patterns. Because all viruses are obligate parasites that require host cells for replication, we globally assessed how IAV1918 induces host protein dysregulation. We performed quantitative mass spectrometry of IAV1918-infected cells to measure host protein dysregulation. Selected proteins were validated by immunoblotting and phosphorylation levels of members of the PI3K/AKT/mTOR pathway were assessed. Compared to mock-infected controls, >170 proteins in the IAV1918-infected cells were dysregulated. Proteins mapped to amino sugar metabolism, purine metabolism, steroid biosynthesis, transmembrane receptors, phosphatases and transcription regulation. Immunoblotting demonstrated that IAV1918 induced a slight up-regulation of the lamin B receptor whereas all other tested virus strains induced a significant down-regulation. IAV1918 also strongly induced Rab5b expression whereas all other tested viruses induced minor up-regulation or down-regulation. IAV1918 showed early reduced phosphorylation of PI3K/AKT/mTOR pathway members and was especially sensitive to rapamycin. These results suggest the 1918 strain requires mTORC1 activity in early replication events, and may explain the unique pathogenicity of this virus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,675
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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