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Enregistrement W2807298850 · doi:10.1038/s41598-018-25767-0

TDP-43 regulation of stress granule dynamics in neurodegenerative disease-relevant cell types

2018· article· en· W2807298850 sur OpenAlexafffund
Yousra Khalfallah, Rachel Kuta, Camille Grasmuck, Alexandre Prat, Heather D. Durham, Christine Vande Velde

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation Brain CanadaALS Society of Canada
Mots-clésNeuroscienceStress granuleBiologyNeurodegenerationCell typeCellDiseaseCell biologyMedicinePathologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stress granules (SGs) are cytoplasmic foci that form in response to various external stimuli and are essential to cell survival following stress. SGs are studied in several diseases, including ALS and FTD, which involve the degeneration of motor and cortical neurons, respectively, and are now realized to be linked pathogenically by TDP-43, originally discovered as a component of ubiquitin-positive aggregates within patients' neurons and some glial cells. So far, studies to undercover the role of TDP-43 in SGs have used primarily transformed cell lines, and thus rely on the extrapolation of the mechanisms to cell types affected in ALS/FTD, potentially masking cell specific effects. Here, we investigate SG dynamics in primary motor and cortical neurons as well as astrocytes. Our data suggest a cell and stress specificity and demonstrate a requirement for TDP-43 for efficient SG dynamics. In addition, based on our in vitro approach, our data suggest that aging may be an important modifier of SG dynamics which could have relevance to the initiation and/or progression of age-related neurodegenerative diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,413
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations164
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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