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Enregistrement W2807613615 · doi:10.1038/s41598-018-20457-3

Conserved DNA Methylation Signatures in Early Maternal Separation and in Twins Discordant for CO2 Sensitivity

2018· article· en· W2807613615 sur OpenAlexaff
Francesca Giannese, Alessandra Luchetti, Giulia Barbiera, Valentina Lampis, Claudio Zanettini, Gun Peggy Knudsen, Simona Scaini, Dejan Lazarević, Davide Cittaro, Francesca R. D’Amato, Marco Battaglia

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNorwegian Institute of Public HealthMinistero della SaluteNational Alliance for Research on Schizophrenia and Depression
Mots-clésDNA methylationEpigeneticsMethylationBiologyOffspringGenedNaMGeneticsTranscriptomePhysiologyGene expressionPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Respiratory and emotional responses to blood-acidifying inhalation of CO2are markers of some human anxiety disorders, and can be enhanced by repeatedly cross-fostering (RCF) mouse pups from their biological mother to unrelated lactating females. Yet, these dynamics remain poorly understood. We show RCF-associated intergenerational transmission of CO2sensitivity in normally-reared mice descending from RCF-exposed females, and describe the accompanying alterations in brain DNA methylation patterns. These epigenetic signatures were compared to DNA methylation profiles of monozygotic twins discordant for emotional reactivity to a CO2challenge. Altered methylation was consistently associated with repeated elements and transcriptional regulatory regions among RCF-exposed animals, their normally-reared offspring, and humans with CO2hypersensitivity. In both species, regions bearing differential methylation were associated with neurodevelopment, circulation, and response to pH acidification processes, and notably included theASIC2gene. Our data show that CO2hypersensitivity is associated with specific methylation clusters and genes that subserve chemoreception and anxiety. The methylation status of genes implicated in acid-sensing functions can inform etiological and therapeutic research in this field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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