MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2807739974 · doi:10.1186/s12879-018-3182-x

Screening swabs surpass traditional risk factors as predictors of MRSA bacteremia

2018· article· en· W2807739974 sur OpenAlexaff
Guillaume Butler‐Laporte, Matthew P. Cheng, Emily G. McDonald, Todd C. Lee

Notice bibliographique

RevueBMC Infectious Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBacteremiaMedical microbiologyColonizationInternal medicineMethicillin-resistant Staphylococcus aureusVancomycinOdds ratioLogistic regressionMedical recordIntensive care medicineEmergency medicineStaphylococcus aureusImmunologyAntibioticsMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Consideration to add empiric MRSA therapy with vancomycin is a common clinical dilemma. However, vancomycin overuse has important adverse events. MRSA colonization screening is commonly performed for infection control. We hypothesized that in cases of S. aureus bacteremia, a score based on patient level factors and MRSA colonization could predict the risk of MRSA infection and inform the need for empiric coverage. METHODS: Using modern machine learning statistical methods (LASSO regression and random forests), we designed a predictive score for MRSA infection based on patient level characteristics, and MRSA colonization as measured by screening done 30 days before infection (30-Day criteria), or at any time before infection (Ever-Positive criteria). Patient factors (age, sex, number of previous admissions, and other medical comorbidities) were obtained through our electronic records. RESULTS: With random forests, MRSA colonization largely surpassed all other factors in terms of accuracy and discriminatory power. Using LASSO regression, MRSA colonization was the only factor with MRSA infection predictive power with odds ratio of 10.3 (min: 5.99, max: 16.1) and 8.14 (min: 6.01, max: 14.8) for the 30-Day and Ever-Positive criteria, respectively. Further, patient comorbidities were not adequate predictors of MRSA colonization. CONCLUSIONS: In an era of community acquired MRSA, colonization status appears to be the only independent and reliable predictor of MRSA infection in cases of S. aureus bacteremia. A clinical approach based on a patient's known MRSA colonization status and on local susceptibility patterns may be appropriate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Infectious DiseasesMême sujetAntimicrobial Resistance in StaphylococcusTravaux en français237 207