MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2807841492 · doi:10.71781/28394

Caractérisation moléculaire et fonctionnelle d'un nouvel allèle du gène de la polarité cellulaire planaire (PCP) Vangl2

2017· dissertation· fr· W2807841492 sur OpenAlexfundno aff
Abdul-Rahman El-Hassan

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2017
Typedissertation
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMolecular biologyBiologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Les anomalies du tube neural (ATN) comme spina bifida, craniorachischisis et anencéphalie, constituent les malformations congénitales les plus communes qui touchent le système nerveux central. Malgré l’effet protecteur de l’acide folique dans 50-70% des cas, ces anomalies font toujours leur apparition dans 1 à 2 nouveau-nés par 1000 naissances. Plusieurs études montrent que les gènes de la voie de polarité cellulaire planaire (PCP) sont impliqués dans le développement embryonnaire comme la migration cellulaire et la convergence et extension. La souris Looptail (Lp) était la première mutante à impliquer un gène de la voie PCP, appelé Vangl2, dans la pathogenèse des ATN chez les mammifères. Dans la présente étude, nous avons investigué une souris mutante de Vangl2 appelée Curly Bob induite par mutagénèse chimique à l’Ethyl-Nitroso-Urée (ENU). La mutation faux-sens induit un changement de l’acide aminé à la position I268 de la protéine Vangl2. Cette mutation est de nature héréditaire semi dominante chez les souris hétérozygotes ayant comme caractéristiques phénotypiques, une queue bouclée, un secouement de tête et un ‘comportement de tours en ronds’. Nous avons aussi remarqué qu’un faible pourcentage de femelles hétérozygotes ne développe pas d’ouverture vaginale. Les embryons homozygotes développent une forme sévère d’ATN et des défauts de PCP sévères dans les cellules ciliées de la cochlée et du système vestibulaire. Cette mutation interagit génétiquement avec l’allèle Lp (Vangl2S464N) dans le développement du tube neural et la polarité des cellules ciliées de l’oreille interne. Le niveau d’expression de la variante de Vangl2I268N mutée chez les homozygotes est bas dans les tissus du système nerveux analysés. Cette mutation affecte aussi l’interaction de Vangl2 avec Dishevelled3. La nouvelle mutante décrite dans cette étude, constitue un modèle important afin de disséquer plus précisément le rapport structure-fonction de Vangl2 dans le développement du tube neural et l’établissement de la polarité dans les cellules sensorielles de l’oreille interne.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,462
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOpen MINDMême sujetMechanisms of cancer metastasisTravaux en français237 207