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Enregistrement W2807925761 · doi:10.1111/ppa.12895

Detection of interactions between the pea root rot pathogens <i>Aphanomyces euteiches</i> and <i>Fusarium</i> spp. using a multiplex <scp>qPCR</scp> assay

2018· article· en· W2807925761 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaAlberta Pulse Growers CommissionAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésBiologyRoot rotFusariumColonizationPythiumPopulationMicrobiologyPathogenFusarium solaniHorticultureVeterinary medicineBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pea root rot complex ( PRRC ) describes a group of closely associated soilborne pathogens that cause root rot disease in field pea. Aphanomyces euteiches and several Fusarium spp. are the most prevalent and damaging microorganisms within this complex, although the impact of interspecific interactions on disease progression remains largely unexplored. Furthermore, a fast and reliable method of detecting and quantifying these pathogens is not currently available. The objectives of this experiment were to: (i) investigate the effect of microbial interactions on root rot severity in pea under greenhouse conditions; and (ii) characterize changes in colonization rates when multiple pathogens are present using qPCR . Seeds were exposed to three species of Fusarium and were planted into A. euteiches ‐infested soil in varying combinations. For each experimental treatment, an index of disease severity was used to visually rate disease symptoms. Additionally, two triplex quantitative PCR ( qPCR ) assays were designed to detect and quantify changes in pathogen population dynamics on the roots. Both assays demonstrated a high degree of sensitivity and efficiency. Results from two independent greenhouse trials indicated an increase in disease severity in the presence of multiple pathogen species compared to single inoculations. Specifically, roots infected with A. euteiches were more susceptible to fusarium root rot than those exposed only to Fusarium spp. These observations were confirmed by qPCR results, which revealed significant changes in colonization rates when multiple species were present. These findings suggest an increased risk of yield loss in regions where A. euteiches and Fusarium spp. co‐occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil0,768

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle