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Enregistrement W2807966757 · doi:10.4236/jbbs.2018.86023

Design and Development of a High-Throughput System for Learning and Memory Research on Zebrafish

2018· article· en· W2807966757 sur OpenAlexafffund
Hamed Hanafi Alamdari, Nancy Kilcup, Zachary K. Ford, Florentin M. Wilfart, David C. Roach, Michael Schmidt

Notice bibliographique

RevueJournal of Behavioral and Brain Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesDalhousie University
Mots-clésZebrafishStimulus (psychology)CognitionComputer sciencePsychologySession (web analytics)Artificial intelligenceCognitive psychologyNeuroscienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Since 2004, zebrafish have become the state-of-the-art, in vivo model for biomedical research due to their genetic and physiological homology with humans, inexpensive high-quantity breeding, and quick development in a highly-controlled environment suitable for longitudinal studies. New Method: To fully utilize the zebrafish model, a novel, automated, high-throughput system was designed. Shoals of five zebrafish were placed in 16 tanks and automatically fed over two days for a total of 16 training sessions. Color LED lights were used as the stimulus for each shoal coinciding with the release of food for a duration of 20 seconds. This system was tested on two age groups: 6- and 11-month-old. Results: After three training sessions, the median height of the school in the tank during stimulus was significantly higher than that of the naïve fish during the first training session. All subsequent training sessions demonstrated similar behaviour. A decline in memory retention, as defined by a reduction in the median height during light stimulus (i.e. no simultaneous food delivery), was observed 8 days post training. Comparison with existing methods: The high-throughput nature of this system allows for simultaneous training of 16 tanks of fish under identical conditions without human interaction and provides a means to rapidly assess their learning and memory behaviours. Conclusion: Results provide a baseline for understanding the normal cognitive processes of learning and memory retention in zebrafish. This work paves the way for future studies on the impacts of therapeutic agents on these cognitive processes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,491

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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