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Enregistrement W2808035184 · doi:10.1016/j.ajic.2018.05.003

Patient- and hospital-level predictors of vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) bacteremia in Ontario, Canada

2018· article· en· W2808035184 sur OpenAlexafffundabout
Jennie Johnstone, Cynthia Chen, Laura C. Rosella, Kwaku Adomako, Michelle E. Policarpio, Freda Lam, Chatura Prematunge, Gary Garber, Gerald A. Evans, Michael Gardam, Susy Hota, Michael John, Kevin Katz, Camille Lemieux, Allison McGeer, Dominik Mertz, Matthew Muller, Virginia Roth, Kathryn N. Suh, Mary Vearncombe

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Infection Control · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity of OttawaInstitute for Clinical Evaluative SciencesSt Joseph's Health CentrePublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Health and Long-Term CareInstitute for Clinical Evaluative Sciences
Mots-clésMedicineBacteremiaOdds ratioConfidence intervalIntensive care unitInternal medicineVancomycin-resistant EnterococcusEnterococcusVancomycinAntibioticsStaphylococcus aureus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Data are limited on risk factors for vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) bacteremia. METHODS: All patients with a confirmed VRE bacteremia in Ontario, Canada, between January 2009 and December 2013 were linked to provincial healthcare administrative data sources and frequency matched to 3 controls based on age, sex, and aggregated diagnosis group. Associations between predictors and VRE bacteremia were estimated by generalized estimating equations and summarized using odds ratios (ORs) and corresponding 95% confidence intervals (CIs). RESULTS: In total, 217 cases and 651 controls were examined. In adjusted analyses, patient-level predictors included bone marrow transplant (OR 106.99 [95% CI 12.19-939.26]); solid organ transplant (OR 17.17 [95% CI 4.95-59.54]); any cancer (OR 8.64 [95% CI 3.88-19.21]); intensive care unit (ICU) admission (OR 6.81 [95% CI 3.53-13.13]); heart disease (OR 5.27 [95% CI 2.00-13.90]); and longer length of stay (OR 1.07 per day [95% CI 1.06-1.09]). Hospital-level predictors included hospital size (per increase in 100 beds (OR 1.26 [95% CI 1.07-1.48]) and teaching hospitals (OR 3.87 [95% CI 1.85-8.08]). CONCLUSIONS: Patients with a bone marrow transplant, solid organ transplant, cancer, or who are admitted to the ICU are at highest risk of VRE bacteremia, particularly at large hospitals and teaching hospitals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentnon

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