Avian influenza surveillance in domestic waterfowl and environment of live bird markets in Bangladesh, 2007–2012
Notice bibliographique
Résumé
Avian influenza viruses, including highly pathogenic strains, pose severe economic, animal and public health concerns. We implemented live bird market surveillance in Bangladesh to identify the subtypes of avian influenza A viruses in domestic waterfowl and market environments. We collected waterfowl samples monthly from 4 rural sites from 2007 to 2012 and environmental samples from 4 rural and 16 urban sites from 2009 to 2012. Samples were tested through real-time RT-PCR, virus culture, and sequencing to detect and characterize avian influenza A viruses. Among 4,308 waterfowl tested, 191 (4.4%) were positive for avian influenza A virus, including 74 (1.9%) avian influenza A/H5 subtype. The majority (99%, n = 73) of the influenza A/H5-positive samples were from healthy appearing waterfowl. Multiple subtypes, including H1N1, H1N3, H3N2, H3N6, H3N8, H4N1, H4N2, H4N6, H5N1 (clades 2.2.2, 2.3.2.1a, 2.3.4.2), H5N2, H6N1, H7N9, H9N2, H11N2 and H11N3, H11N6 were detected in waterfowl and environmental samples. Environmental samples tested positive for influenza A viruses throughout the year. Avian influenza viruses, including H5N1 and H9N2 subtypes were also identified in backyard and small-scale raised poultry. Live bird markets could be high-risk sites for harboring the viruses and have the potential to infect naive birds and humans exposed to them.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».