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Enregistrement W2808364202 · doi:10.1002/ana.25266

Targeted brain proteomics uncover multiple pathways to Alzheimer's dementia

2018· article· en· W2808364202 sur OpenAlexaff
Lei Yu, Vladislav Petyuk, Chris Gaiteri, Sara Mostafavi, Tracy L. Young‐Pearse, Raj C. Shah, Aron S. Buchman, Julie A. Schneider, Paul Piehowski, Ryan Sontag, Thomas Fillmore, Tujin Shi, Richard Smith, Philip L. De Jager, David A. Bennett

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesIllinois Department of Public HealthU.S. Department of Energy
Mots-clésProteomicsDementiaNeuroscienceAlzheimer's diseaseComputational biologyMedicinePsychologyBiologyDiseasePathologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Previous gene expression analysis identified a network of coexpressed genes that is associated with β-amyloid neuropathology and cognitive decline in older adults. The current work targeted influential genes in this network with quantitative proteomics to identify potential novel therapeutic targets. METHODS: Data came from 834 community-based older persons who were followed annually, died, and underwent brain autopsy. Uniform structured postmortem evaluations assessed the burden of β-amyloid and other common age-related neuropathologies. Selected reaction monitoring quantified cortical protein abundance of 12 genes prioritized from a molecular network of aging human brain that is implicated in Alzheimer's dementia. Regression and linear mixed models examined the protein associations with β-amyloid load and other neuropathological indices as well as cognitive decline over multiple years preceding death. RESULTS: ), and the association of PLXNB1 with cognitive decline is mediated by these known Alzheimer's disease pathologies. On the other hand, higher IGFBP5, HSPB2, and AK4 and lower ITPK1 levels were associated with faster cognitive decline, and, unlike PLXNB1, these associations were not fully explained by common neuropathological indices, suggesting novel mechanisms leading to cognitive decline. INTERPRETATION: Using targeted proteomics, this work identified cortical proteins involved in Alzheimer's dementia and begins to dissect two different molecular pathways: one affecting β-amyloid deposition and another affecting resilience without a known pathological footprint. Ann Neurol 2018;83:78-88.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations132
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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