Spathaspora passalidarum selected for resistance to AFEX hydrolysate shows decreased cell yield
Notice bibliographique
Résumé
This study employed cell recycling, batch adaptation, cell mating and high-throughput screening to select adapted Spathaspora passalidarum strains with improved fermentative ability. The most promising candidate YK208-E11 (E11) showed a 3-fold increase in specific fermentation rate compared to the parental strain and an ethanol yield greater than 0.45 g/g substrate while co-utilizing cellobiose, glucose and xylose. Further characterization showed that strain E11 also makes 40% less biomass compared to the parental strain when cultivated in rich media under aerobic conditions. A tetrazolium agar overlay assay in the presence of respiration inhibitors, including rotenone, antimycin A, KCN and salicylhydroxamic acid elucidated the nature of the mutational events. Results indicated that E11 has a deficiency in its respiration system that could contribute to its low cell yield. Strain E11 was subjected to whole genome sequencing and an ∼11 kb deletion was identified; the open reading frames absent in strain E11 code for proteins with predicted functions in respiration, cell division and the actin cytoskeleton, and may contribute to the observed physiology of the adapted strain. Results of the tetrazolium overlay also suggest that cultivation on xylose affects the respiration capacity in the wild-type strain, which could account for its faster fermentation of xylose as compared to glucose. These results support our previous finding that S. passalidarum has highly unusual physiological responses to xylose under oxygen limitation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».