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Enregistrement W2808856519 · doi:10.1038/s41467-018-04952-9

Natural selection of a GSK3 determines rice mesocotyl domestication by coordinating strigolactone and brassinosteroid signaling

2018· article· en· W2808856519 sur OpenAlexfundno aff
Shiyong Sun, Tao Wang, Linlin Wang, Xiaoming Li, Yancui Jia, Chang Liu, Xuehui Huang, Weibo Xie, Xuelu Wang

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBrassinosteroidStrigolactoneDomesticationBiologyCell biologyArabidopsisBotanyGeneticsMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mesocotyl is the crucial organ for pushing buds out of deep water or soil after germination in monocots. Deep direct seeding or mechanized dry seeding cultivation practice requires rice cultivars having long mesocotyl. However, the mechanisms of mesocotyl elongation and domestication remain unknown. Here, our genome-wide association study (GWAS) reveals that natural variations of OsGSK2, a conserved GSK3-like kinase involved in brassinosteroid signaling, determine rice mesocotyl length variation. Variations in the coding region of OsGSK2 alter its kinase activity. It is selected for mesocotyl length variation during domestication. Molecular analyses show that brassinosteroid-promoted mesocotyl elongation functions by suppressing the phosphorylation of an U-type cyclin, CYC U2, by OsGSK2. Importantly, the F-box protein D3, a major positive component in strigolactone signaling, can degrade the OsGSK2-phosphorylated CYC U2 to inhibit mesocotyl elongation. Together, these results suggest that OsGSK2 is selected to regulate mesocotyl length by coordinating strigolactone and brassinosteroid signaling during domestication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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