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Enregistrement W2808982957 · doi:10.1101/350389

Neuropathological correlates and genetic architecture of microglial activation in elderly human brain

2018· preprint· en· W2808982957 sur OpenAlexfundno aff
Daniel Felsky, Tina Roostaei, Kwangsik Nho, Shannon L. Risacher, Elizabeth M. Bradshaw, Vladislav Petyuk, Julie A. Schneider, Andrew J. Saykin, David A. Bennett, Philip L. De Jager

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchTranslational Genomics Research InstituteIllinois Department of Public Health
Mots-clésMicrogliaNeuropathologyNeuroscienceCognitive declineHuman brainDementiaAmyloid (mycology)DiseaseNeurodegenerationPsychologyBiologyMedicinePathologyInflammationImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Microglia, the resident immune cells of the brain, have important roles in brain health. However, little is known about the regulation and consequences of microglial activation in the aging human brain. We assessed the effect of microglial activation in the aging human brain by calculating the proportion of activated microglia (PAM), based on morphologically defined stages of activation in four regions sampled postmortem from up to 225 elderly individuals. We found that cortical and not subcortical PAM measures were strongly associated with β-amyloid, tau-related neuropathology, and rates of cognitive decline. Effect sizes for PAM measures are substantial, comparable to that of APOE ɛ4, the strongest genetic risk factor for Alzheimer’s disease. Mediation modeling suggests that PAM accelerates accumulation of tau pathology leading to cognitive decline, supporting an upstream role for microglial activation in Alzheimer’s disease. Genome-wide analyses identified a common variant (rs2997325) influencing cortical PAM that also affected in vivo microglial activation measured by positron emission tomography using [ 11 C]-PBR28 in an independent cohort. Finally, we identify overlaps of PAM’s genetic architecture with those of Alzheimer’s disease, educational attainment, and several other traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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