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Enregistrement W2809011355 · doi:10.1093/neuonc/noy059.506

MBRS-62. REPRESSIVE CHROMATIN REMODELERS IN SHH-DRIVEN MEDULLOBLASTOMA

2018· article· en· W2809011355 sur OpenAlexaff
Rong‐Hua Tao, Tara Dobson, Shinji Maegawa, Jyothismathi Swaminathan, Shavali Shaik, Pete Taylor, Bridget Kennis, Lin Qi, Soumen Khatua, Stewart Goldman, Rishi Lulla, Jason Fangusaro, Tobey J. MacDonald, Xiao‐Nan Li, Cynthia Hawkins, Veena Rajaram, Vidya Gopalakrishnan

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSonic hedgehogMedulloblastomaBiologyCancer researchChromatinNeurogenesisCell biologyGeneticsGeneSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma (MB) is a malignant pediatric brain tumor characterized by poor neuronal differentiation. The RE1 Silencing Transcription Factor (REST), which negatively regulates neurogenesis by promoting repressive chromatin remodeling via epigenetic modifications, is overexpressed in human MBs. Analyses of a publically available gene expression array data set revealed association of elevated REST expression in patients with Sonic Hedgehog (SHH) medulloblastoma with poor prognosis. Upon closer evaluation, we identified a subset of highly undifferentiated SHHα tumors with elevated REST expression and activity as determined by expression of REST target genes. These patients had an overall survival rate of 50% at 5 years. To understand the underlying mechanisms, we generated a novel mouse model expressing human REST transgene in a conditional manner in granule neural progenitors (GNPs), the cells of origin of SHH driven MB. Mice with constitutive activation of Shh signaling and REST elevation (Ptch+/-/RESTTG) in their GNPs developed tumors with a significant decrease in latency and increase in penetrance. We observed that 100% of Ptch+/-/RESTTG animals developed heterogeneously proliferative and undifferentiated tumors compared to tumor-bearing Ptch+/- animals. Mechanistic studies revealed deregulation of the Shh signaling pathway by REST-dependent G9a activity, accompanied by loss of Ptch1 heterozygosity in Ptch+/-/RESTTG tumors. Thus, our studies suggest that REST contributes to mis-regulation of SHH activity and drives an aggressive disease course by deregulating proliferation and differentiation. Ours is also the first study to implicate G9a, a repressive chromatin remodeler, in medulloblastoma pathogenesis and as a potential therapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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