MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2809067715 · doi:10.2337/db18-439-p

Do Greenlandic Carriers of the TBC1D4 p.Arg684Ter Variant Have Increased Risk of Cardiovascular Disease?

2018· article· en· W2809067715 sur OpenAlexaboutno aff
Marit E. Jørgensen, Maria Tvermosegaard, Pernille Falberg Rønn, Peter Bjerregaard, Inger Katrine Dahl‐Petersen, Christina Viskum Lytken Larsen, Michael Lynge Pedersen, Anders Albrechtsen, Ida Moltke, Niels Grarup, Torben Hansen

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineBlood pressureOdds ratioPopulationDiabetes mellitusIncidence (geometry)Insulin resistanceObesityEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The nonsense polymorphism p.Arg684Ter in the TBC1D4 gene is associated with severe skeletal muscle insulin resistance and postprandial hyperglycemia in the Greenlandic population. Homozygous carriers have an increased risk for type 2 diabetes (odds ratio of 10.3) and the variant has an allele frequency of 17% with 4% homozygous carriers in the population. However, we do not know, if p.Arg684Ter carrier status also confers a greater risk of cardiovascular disease (CVD). Thus the aim is to investigate if carriers of the variant are more at risk of CVD than non-carriers. Materials and Methods: The study included adult participants in the Inuit Health in Transition study completed in the years 2005-2010 with sampling from 12 regions in Greenland (n= 3115) and the B99 study conducted from 1999-2001 (n=1401). Outcome was a first time CVD event from the Greenlandic Patien Register or the Causes of Death Register. Incidence rates of CVD were estimated by Poisson regression for wild type, heterozygous and homozygous carriers followed until the end of 2013, adjusted for European admixture proportion, age, sex, smoking, lipids, blood pressure, lipid- and blood pressure lowering drugs, blood glucose and known diabetes. Results: During a median follow-up time of 7 years [IQR: 5.0, 10.0], 273 had an incident CVD event, 13 events among homozygous (HO), and 78 events among heterozygous (HE) carriers. Both in crude and adjusted analyses, there was a higher risk of incident CVD with p.Arg684Ter carrier status, although not statistically significant, with unadjusted incidence rate ratios (IRR) of 2.2 [CI 0.3- 15.5] for HO vs. WT; multivariable adjusted IRR 1.6 [0.12-19.5] for HO vs. WT. The same pattern was seen for HE vs. WT. Conclusions: Overall, there was a trend towards increased risk of incident CVD with the TBC1D4 p.Arg684Ter variant although not statistically significant. Lack of statistical power may partly explain this, and replication in a larger sample or longer follow-up is needed. Disclosure M.E. Jørgensen: Stock/Shareholder; Self; Novo Nordisk A/S. Research Support; Self; AstraZeneca, Amgen Inc.. M. Tvermosegaard: None. P.F. Rønn: Employee; Spouse/Partner; Novo Nordisk A/S. Stock/Shareholder; Spouse/Partner; Novo Nordisk A/S. P. Bjerregaard: None. I.K. Dahl-Petersen: None. C.V. Larsen: None. M.L. Pedersen: None. A. Albrechtsen: None. I. Moltke: None. N. Grarup: None. T. Hansen: None.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDiabetesMême sujetMetabolism, Diabetes, and CancerTravaux en français237 207