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Enregistrement W2809299590 · doi:10.1093/neuonc/noy059.406

MBCL-08. MOLECULAR CHARACTERIZATION OF NODULAR DESMOPLASTIC MEDULLOBLASTOMAS IN YOUNG CHILDREN TREATED ON ACNS1221. A REPORT FROM THE CHILDREN ONCOLOGY GROUP

2018· article· en· W2809299590 sur OpenAlexaff
Lucie Lafay‐Cousin, Giles Robinson, Vasilisa A. Rudneva, Paul A. Northcott, Catherine A. Billups, Arzu Onar‐Thomas, Cynthia Hawkins, Charles G. Eberhart, Craig Horbinski, Linda Heier, Mark Souweidane, Douglas Strother, Maryam Fouladi, Éric Bouffet, Amar Gajjar

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenAlberta Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaCohortSonic hedgehogMedicineOncologyInternal medicinePathologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ACNS1221 was a single-arm multicenter trial of conventional chemotherapy for children < 4y with localized nodular desmoplastic medulloblastoma and medulloblastoma with extensive nodularity(ND/MBEN), based on a modified HIT SKK 2000 regimen excluding intraventricular methotrexate. The trial prematurely closed for an excess of relapses. Here we provide the final analysis of the clinical and molecular characterization of the cohort. Tumor samples were prospectively collected to describe the molecular profile of ND/MBEN. DNA methylation was performed using Infinium MethylationEPIC BeadChip and profiled on DKFZ molecularneuropathology2.0 classifier. DNA copy-number variants were inferred from DNA methylation arrays using Conumee. Methylation profiles were added to a founder cohort of 87 infant SHH-MB and analyzed by t-distributed stochastic neighbor embedding (t-SNE) to delineate SHH-I and SHH-II subtypes. The cohort included 26 patients(19 ND and 7 MBEN) diagnosed at a median age of 19.7 months. All tumors clustered within the SHH group and separated into 2 subtypes: SHH-I(42%) and SHH-II(58%). SHH-I patients were significantly older than SHH-II patients (p=0.009). Most MBEN were SHH-II(86%) but no significant association was found between histology and subgrouping(p=0.18). Chromosome 2 gain was exclusively described in SHH-I. Eight relapses occurred in SHH-I and 4 in SHH-II (median time of 9.8 months). The 2y PFS for SHH-I and SHH-II was respectively 27.3%(+/-13.4%) and 73.3%(+/-13.4%) (p=0.034). Age <12 mos, MBEN histology and female sex were associated with better PFS. With the ACNS1221 cohort, we prospectively validated the existence of 2 SHH subgroups in young children and the worse outcome of SHH-I subgroup.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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