Molecular characterization of ageratum enation virus and DNA-satellites associated with yellowing and leaf curl symptoms on mulberry in Pakistan
Notice bibliographique
Résumé
The whitefly-transmitted begomoviruses (family Geminiviridae) infect dicotyledonous plants and occur in tropical and sub-tropical regions. Although most commonly found in herbaceous plants, recently begomoviruses have increasingly been identified in woody plants. Leaf samples from five mulberry (Morus alba L.) plants with leaf yellowing and curling symptoms were collected in Lahore (Pakistan) and shown by PCR to be associated with a begomovirus, an alphasatellite and a betasatellite. The complete sequences of two begomovirus clones, as well as an alphasatellite clone and a betasatellite clone, were determined. The begomovirus clones were shown to be isolates of ageratum enation virus (AEV), a virus most commonly identified in weeds but increasingly being identified in crops such as tomato, soybean and fenugreek. Analyses of the sequences of the alphasatellite and betasatellite clones showed them to be isolates of Guar leaf curl alphasatellite and Papaya leaf curl betasatellite, respectively. Both the virus and the alphasatellite sequences showed evidence of a recombination. This is the first report of the weed-infecting monopartite begomovirus AEV, and associated satellites, infecting the woody plant mulberry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».