Development of Endocyclic Control Elements for Peptide Macrocycles
Notice bibliographique
Résumé
Synthetic methods that provide control over macrocycle conformation represent valuable tools for the discovery of bioactive molecules. Incorporation of heterocycles into cyclic peptides may offer a way to stabilize their solution conformations. Herein, we used N-(isocyanimino)triphenylphosphorane (Pinc) to install an oxadiazole ring and an endocyclic amine into peptide macrocycles. To elucidate the conformational effect of this constellation of functionalities, we performed synthesis, variable temperature NMR analysis, and NOE-based molecular dynamics simulation of a range of macrocycles in DMSO. As part of this study, we conducted experiments to compare macrocycle conformation in aqueous and DMSO solutions. The obtained solution structures suggest that the reduced amide bond/heterocycle (RAH) motif can stabilize macrocycle conformations in both water and DMSO, which addresses an enduring challenge in molecular design. The conformational effect of the RAH was used in an effort to mimic the biologically relevant secondary structure of MAdCAM-1. This resulted in the discovery of a novel α4β7 integrin antagonist.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».