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Enregistrement W2809463855 · doi:10.1093/neuonc/noy059.400

LGG-60. THE GENETIC LANDSCAPE OF PEDIATRIC LOW-GRADE GLIOMAS: INCIDENCE, PROGNOSIS AND RESPONSE TO THERAPY

2018· article· en· W2809463855 sur OpenAlexaff
Scott Ryall, Michal Zápotocký, Kohei Fukuoka, Ana Guerreiro Stücklin, J Bennet, Anthony Arnoldo, Paul E. Kowalski, Monique Johnson, Álvaro Lassaletta, Ute Bartels, Annie Huang, Vijay Ramaswamy, David W. Ellison, Uri Tabori, Cynthia Hawkins

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCohortIDH1OncologyInternal medicineIncidence (geometry)Targeted therapyGliomaCumulative incidencePathologyCancer researchMutationCancerGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecularly characterization of pediatric low-grade glioma (pLGG) over the last decade has identified recurrent alterations, most commonly involving BRAF, and less frequently other pathways including MYB and MYBL1. Many of these molecular markers have been exploited clinically to aid in diagnosis and treatment decisions. However, their frequency and their prognostic significance remain unknown. Further, a significant portion of cases do not have any of these alterations and what underlies these cases is also unknown. To address this we compiled a cohort of 562 patients diagnosed at SickKids from 1990-2017. We identified molecular alterations in 454 (81%) of the cohort. The most frequent events were those involving BRAF; either as fusions (most commonly with KIAA1549 (30%)), or V600E mutations (17%) and NF-1 (22%). Less frequently, we identified recurrent FGFR1 fusions and mutations (3%), MYB/MYBL alterations (2%), H3F3A_K27M mutations (2%) and IDH1_R132H (0.5%), as well as other novel rare events. Survival analysis revealed significantly better progression-free survival (PFS) and overall survival (OS) of BRAF-KIAA1549 patients compared to BRAF_V600E with 10-year OS 97.7% (95%CI 95.5-100) and 83.9% (95%CI 72.5-95.6) respectively. In addition to survival, the molecular alterations predict differences in response to conventional therapeutics; BRAF fused patients show a 46% response-rate, versus only 14% in V600E patients. pLGG harboring H3F3A_K27M progressed early with median PFS of 11 months. In patients with MYB/MYBL1, FGFR1/FGFR2 alterations, we observed only one death (FGFR1_N546K case). The work here represents the largest cohort of pLGGs with molecular profiling and their impact on the clinical behaviour of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,565
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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