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Enregistrement W2809594451 · doi:10.1093/neuonc/noy059.199

EMBR-15. DIAGNOSTIC RE-EVALUATION AND POOLED CLINICAL DATA ANALYSIS OF PATIENTS WITH PREVIOUS DIAGNOSIS OF CNS-PNET

2018· article· en· W2809594451 sur OpenAlexaff
Katja von Hoff, Christine Haberler, Giles Robinson, David Sumerauer, Jaeho Cho, Martin Mynarek, Eugene Hwang, Sandra Jacobs, Teresa de Rojas, Martha Perek, Christelle Dufour, Matija Snuderl, Richard G. Grundy, Maria João Gil‐da‐Costa, Dannis G. van Vuurden, Irene Slavc, Nicolas U. Gerber, Jessica C. Pickles, Amar Gajjar, Barry Pizer, Stefan Rutkowski, David Capper, Dominik Sturm, Brent A. Orr, Pieter Wesseling, Péter Hauser, Maria Łastowska, Andrey Korshunov, Tom Jacques, Felice Giangaspero, Cynthia Hawkins, Dominique Figarella, Charles G. Eberhart, Peter C. Burger, Marco Gessi, Stefan M. Pfister, Torsten Pietsch, Marcel Kool

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOncologyInternal medicineDNA methylationDiseaseGliomaPathologyCancer researchBiologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CNS-PNET is no longer regarded a single disease but encompassed many distinct molecular entities. After removal of the term from the 2016 WHO classification of CNS tumours, diagnostic and therapeutic uncertainty remains. Through a world-wide collaboration, tumour samples from patients with the “historic” diagnosis of CNS-PNET were re-evaluated by DNA methylation profiling (n=405) and blinded neuropathological panel review (n=256). Clinical data on treatment and outcome were pooled with data on previously published patients. The given numbers represent preliminary data of the ongoing project. The re-evaluation by DNA methylation identified many distinct entities as expected, including high grade glioma (HGG, n=70), embryonal tumors with multilayered rosettes (ETMR, n=57) and CNS-neuroblastoma with FOXR2 alteration (CNS-NB-FOXR2, n=42) as the most frequent molecular diagnostic categories. Poor clinical outcome was confirmed for patients with HGG (5y-PFS 12%/5y-OS 12%, n=24), and ETMR (5y-PFS 12%/5y-OS 18%, n=62), while most patients with CNS-NB-FOXR2 survived (5y-PFS 52%/5y-OS 96%, n=31). Seven of 12 relapses/progressions of CNS-NB-FOXR2 occurred in radiotherapy-naïve patients. Classification into other newly described and less common entities included HGNET-MN1 (n=19), HGNET-BCOR (n=11), and EFT-CIC (n=13). Independent neuropathological review demonstrated that samples of these entities presented as non-embryonal tumours. Furthermore, marked clinical differences exist (HGNET-MN1: 5y-PFS 25%/5y-OS 95%, n=22; HGNET-BCOR: 5y-PFS 0%/5y-OS 44%, n=16; CNS-EFT-CIC: 5y-PFS 40%/5y-OS 60%, n=10). Our results show that implementation of DNA methylation profiling together with histopathological analysis will improve prospective diagnostic accuracy and facilitates the retrospective outcome analysis of treatment protocols used for this variety of biologically distinct entities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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