MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2809632570 · doi:10.1098/rspb.2018.0519

Intercontinental karyotype–environment parallelism supports a role for a chromosomal inversion in local adaptation in a seaweed fly

2018· article· en· W2809632570 sur OpenAlexafffund
Claire Mérot, Emma L. Berdan, Charles Babin, Éric Normandeau, Maren Wellenreuther, Louis Bernatchez

Notice bibliographique

RevueProceedings of the Royal Society B Biological Sciences · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHorizon 2020 Framework ProgrammeFonds de Recherche du Québec - SantéVetenskapsrådet
Mots-clésChromosomal inversionBiologyCline (biology)Local adaptationEvolutionary biologyInversion (geology)EcologyBalancing selectionKaryotypeEcotypePopulationGeneticsGenetic variationPaleontologyDemographyChromosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Large chromosomal rearrangements are thought to facilitate adaptation to heterogeneous environments by limiting genomic recombination. Indeed, inversions have been implicated in adaptation along environmental clines and in ecotype specialization. Here, we combine classical ecological studies and population genetics to investigate an inversion polymorphism previously documented in Europe among natural populations of the seaweed fly Coelopa frigida along a latitudinal cline in North America. We test if the inversion is present in North America and polymorphic, assess which environmental conditions modulate the inversion karyotype frequencies, and document the relationship between inversion karyotype and adult size. We sampled nearly 2000 flies from 20 populations along several environmental gradients to quantify associations of inversion frequencies to heterogeneous environmental variables. Genotyping and phenotyping showed a widespread and conserved inversion polymorphism between Europe and America. Variation in inversion frequency was significantly associated with environmental factors, with parallel patterns between continents, indicating that the inversion may play a role in local adaptation. The three karyotypes of the inversion are differently favoured across micro-habitats and represent life-history strategies likely to be maintained by the collective action of several mechanisms of balancing selection. Our study adds to the mounting evidence that inversions are facilitators of adaptation and enhance within-species diversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProceedings of the Royal Society B Biological SciencesMême sujetMarine and coastal plant biologyTravaux en français237 207