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Identification of Novel HIV-1 Latency-Reversing Agents from a Library of Marine Natural Products

2018· article· en· 42 citations· W2809929835 sur OpenAlex· 10.3390/v10070348

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.
Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

gemmalow
Catégories: aucune catégorie
Devis d'étude: Expérimental (laboratoire)
Domaine: non disponible
Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non
Porte sur un sujet canadien: non
gptmedium
Catégories: aucune catégorie
Devis d'étude: Expérimental (laboratoire)
Domaine: non disponible
Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non
Porte sur un sujet canadien: non

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates
aucune
Catégories consensuelles
aucune
Domaine
Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude
Signal candidat: Expérimental (laboratoire)Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
Genre
Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants
0,078
Score d'incertitude au seuil
0,744
Statut de validation
machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants
0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

model of HIV-1 latency, we screened 257 pure compounds from a marine natural product library and identified 4 (psammaplin A, aplysiatoxin, debromoaplysiatoxin, and previously-described alotaketal C) that induced expression of latent HIV-1 provirus in both cell line and primary cell models. Notably, aplysiatoxin induced similar levels of HIV-1 expression as prostratin but at up to 900-fold lower concentrations and without substantial effects on cell viability. Psammaplin A enhanced HIV-1 expression synergistically when treated in combination with the protein kinase C (PKC) activator prostratin, but not the histone deacetylase inhibitor (HDACi) panobinostat, suggesting that psammaplin A functions as a latency-reversing agent (LRA) of the HDACi class. Conversely, aplysiatoxin and debromoaplysiatoxin synergized with panobinostat but not prostratin, suggesting that they function as PKC activators. Our study identifies new compounds from previously untested marine natural products and adds to the repertoire of LRAs that can inform therapeutic “shock-and-kill”-based strategies to eliminate latent HIV-infected reservoirs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Viruses
Thématique
HIV Research and Treatment
Domaine
Immunology and Microbiology
Établissements canadiens
AIDS VancouverUniversity of British ColumbiaSimon Fraser University
Organismes subventionnaires
Wellcome TrustCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Foundation for AIDS Research
Mots-clés
PanobinostatBiologyHuman immunodeficiency virus (HIV)Histone deacetylaseChemistryVirologyBiochemistryHistoneGene
Résumé présent dans OpenAlex
oui