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Enregistrement W2809940376 · doi:10.1101/359513

A large-scale, standardized physiological survey reveals higher order coding throughout the mouse visual cortex

2018· preprint· en· W2809940376 sur OpenAlexfundno aff
Saskia de Vries, Jérôme Lecoq, Michael A. Buice, Peter A. Groblewski, Gabriel Koch Ocker, Michael Oliver, David Feng, Nicholas Cain, Peter Ledochowitsch, Daniel Millman, Kate Roll, Marina Garrett, Tom Keenan, Leonard Kuan, Ştefan Mihalaş, Shawn R. Olsen, Carol L. Thompson, Wayne Wakeman, Jack Waters, Derric Williams, Chris Barber, Nathan Berbesque, Brandon Blanchard, Nicholas Bowles, Shiella Caldejon, Linzy Casal, Andrew Cho, Sissy Cross, Chinh Dang, Tim Dolbeare, Melise M. Edwards, John Galbraith, Nathalie Gaudreault, Fiona Griffin, Perry Hargrave, Robert Howard, Lawrence Huang, Sean Jewell, Nika H. Keller, Ulf Knoblich, Josh Larkin, Rachael Larsen, Chris Lau, Eric Lee, Felix Lee, Arielle Leon, Lu Li, Fuhui Long, Jennifer Luviano, Kyla Mace, Thuyanh V. Nguyen, Jed Perkins, Miranda Robertson, Sam Seid, Eric Shea‐Brown, Jianghong Shi, Nathan Sjoquist, Cliff Slaughterbeck, David Sullivan, Ryan Valenza, Casey White, Ali Williford, Daniela Witten, Jun Zhuang, Hongkui Zeng, Colin Farrell, Lydia Ng, Amy Bernard, John W. Phillips, R. Clay Reid, Christof Koch

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésVisual cortexNeural codingNeuroscienceCoding (social sciences)Sensory systemStimulus (psychology)Computer scienceConvolutional neural networkPsychologyArtificial intelligenceCognitive psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary To understand how the brain processes sensory information to guide behavior, we must know how stimulus representations are transformed throughout the visual cortex. Here we report an open, large-scale physiological survey of neural activity in the awake mouse visual cortex: the Allen Brain Observatory Visual Coding dataset. This publicly available dataset includes cortical activity from nearly 60,000 neurons collected from 6 visual areas, 4 layers, and 12 transgenic mouse lines from 221 adult mice, in response to a systematic set of visual stimuli. Using this dataset, we reveal functional differences across these dimensions and show that visual cortical responses are sparse but correlated. Surprisingly, responses to different stimuli are largely independent, e.g. whether a neuron responds to natural scenes provides no information about whether it responds to natural movies or to gratings. We show that these phenomena cannot be explained by standard local filter-based models, but are consistent with multi-layer hierarchical computation, as found in deeper layers of standard convolutional neural networks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations152
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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