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Enregistrement W2810083948 · doi:10.1002/jrs.5410

Genetic support vector machines as powerful tools for the analysis of biomedical Raman spectra

2018· article· en· W2810083948 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Raman Spectroscopy · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSupport vector machineRaman spectroscopyArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Hyperparameter optimizationKernel (algebra)Computer scienceGenetic algorithmProjection (relational algebra)Biological systemMachine learningMathematicsAlgorithmBiologyOpticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The growing number of applications of Raman spectroscopy in medicine necessitates the development of robust and accurate processing methods. The two major tasks for which Raman spectra are used are quantifying chemical species in a sample (regression) and discriminating chemically distinct samples (classification). Conventionally, linear techniques, primarily projection to latent structures (PLS), are used to perform these tasks. However, there are a number of nonlinearities that may arise when acquiring the Raman spectra of biomedical samples, such as scattering differences between tissues or autofluorescence variances, which makes nonlinear methods more suitable. To this end, we compared kernelized support vector machines (SVM) to PLS for a number of biomedical Raman datasets. Additionally, this work develops a genetic SVM, wherein the parameters of a SVM are selected by a classical genetic algorithm instead of the conventional grid search. This facilitates the use of complex kernels, which yield higher performance than simple kernel functions. We have found that this genetic SVM outperforms PLS in all of the regression tasks examined in this paper, while yielding equivalent results for classification tasks. Additionally, we have found that the genetic algorithm provides significant time savings in the optimization of the SVM parameters over grid search.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle