Of what use is connectomics? A personal perspective on the<i>Drosophila</i>connectome
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The brain is a network of neurons and its biological output is behaviour. This is an exciting age, with a growing acknowledgement that the comprehensive compilation of synaptic circuits densely reconstructed in the brains of model species is now both technologically feasible and a scientifically enabling possibility in neurobiology, much as 30 years ago genomics was in molecular biology and genetics. Implemented by huge advances in electron microscope technology, especially focused ion beam-scanning electron microscope (FIB-SEM) milling (see Glossary), image capture and alignment, and computer-aided reconstruction of neuron morphologies, enormous progress has been made in the last decade in the detailed knowledge of the actual synaptic circuits formed by real neurons, in various brain regions of the fly Drosophila. It is useful to distinguish synaptic pathways that are major, with 100 or more presynaptic contacts, from those that are minor, with fewer than about 10; most neurites are both presynaptic and postsynaptic, and all synaptic sites have multiple postsynaptic dendrites. Work on Drosophila has spearheaded these advances because cell numbers are manageable, and neuron classes are morphologically discrete and genetically identifiable, many confirmed by reporters. Recent advances are destined within the next few years to reveal the complete connectome in an adult fly, paralleling advances in the larval brain that offer the same prospect possibly within an even shorter time frame. The final amendment and validation of segmented bodies by human proof-readers remains the most time-consuming step, however. The value of a complete connectome in Drosophila is that, by targeting to specific neurons transgenes that either silence or activate morphologically identified circuits, and then identifying the resulting behavioural outcome, we can determine the causal mechanism for behaviour from its loss or gain. More importantly, the connectome reveals hitherto unsuspected pathways, leading us to seek novel behaviours for these. Circuit information will eventually be required to understand how differences between brains underlie differences in behaviour, and especially to herald yet more advanced connectomic strategies for the vertebrate brain, with an eventual prospect of understanding cognitive disorders having a connectomic basis. Connectomes also help us to identify common synaptic circuits in different species and thus to reveal an evolutionary progression in candidate pathways.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,008 |
| Communication savante | 0,009 | 0,013 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,011 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,013 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».