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Enregistrement W2810329071 · doi:10.1017/cjn.2018.235

P.133 Expanding the phenotype of TRNT1 mutations to include Leigh syndrome

2018· article· en· W2810329071 sur OpenAlexaffvenue
Carolina Gorodetsky, CF Morel, Ingrid Tein

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensSystems, Applications & Products in Data Processing (Canada)Toronto Public HealthNorth York General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlobal developmental delayMedicineJoubert syndromeLeukoencephalopathyDystoniaPathologyAtaxiaPediatricsPhenotypeGeneticsBiologyCilium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Children with biallelic mutations in TRNT1 have multi-organ involvement with congenital sideroblastic anemia, -B-cell immunodeficiency, periodic fevers, and developmental delay (SIFD) as well as seizures, ataxia and sensorineural hearing loss. The TRNT1 gene encodes the CCA-adding enzyme essential for maturation of both nuclear and mitochondrial transfer RNAs accounting for phenotypic pleitropy. Neurodegenerative Leigh syndrome has not been previously reported. Methods:Case summary: A Portuguese boy presented with global developmental delay, 2 episodes of infantile Leigh encephalopathy at 8 mo and 4 yr responsive to high-dose steroids, slow neurodegeneration of cognitive, language and motor functions with optic atrophy, pigmentary retinopathy, spasticity, dystonia, and focal dyscognitive seizures, pancytopenia, transfusion dependent sideroblastic anemia, recurrent febrile infections (pulmonary, gastrointestinal), hypernatremia, with tracheostomy dependence at age 5 yr, malabsorption and TPN dependence at 9 yr, and survival to early adulthood. Neuroimaging showed symmetric hemorrhagic lesions in the thalamus, brain stem (periaqueductal grey) and cerebellum consistent with Leigh syndrome but no lactate peak on MRS. Results: Whole exome sequencing identified a homozygous missense pathogenic variant in TRNT1, c.668T>C (p.I223T) in the affected individual. Conclusions: This report expands the neurological phenotype of TRNT1 mutations and highlights the importance of considering this gene in the evaluation of Leigh syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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