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Enregistrement W2810382848 · doi:10.1186/s13068-018-1177-x

Stepwise metabolic engineering of Escherichia coli to produce triacylglycerol rich in medium-chain fatty acids

2018· article· en· W2810382848 sur OpenAlexaff
Lin Xu, Lian Wang, Xue‐Rong Zhou, Wenchao Chen, Surinder Singh, Zhe Hu, Fenghong Huang, Xia Wan

Notice bibliographique

RevueBiotechnology for Biofuels · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesChinese Academy of Agricultural SciencesAgricultural Science and Technology Innovation ProgramMinistry of Science and Technology of the People's Republic of China
Mots-clésMetabolic engineeringEscherichia coliFood scienceBiochemistryChemistryBiotechnologyBiologyMicrobiologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Triacylglycerols (TAGs) rich in medium-chain fatty acids (MCFAs, C10–14 fatty acids) are valuable feedstocks for biofuels and chemicals. Natural sources of TAGs rich in MCFAs are restricted to a limited number of plant species, which are unsuitable for mass agronomic production. Instead, the modification of seed or non-seed tissue oils to increase MCFA content has been investigated. In addition, microbial oils are considered as promising sustainable feedstocks for providing TAGs, although little has been done to tailor the fatty acids in microbial TAGs. Here, we first assessed various wax synthase/acyl-coenzyme A:diacylglycerol acyltransferases, phosphatidic acid phosphatases, acyl-CoA synthetases as well as putative fatty acid metabolism regulators for producing high levels of TAGs in Escherichia coli . Activation of endogenous free fatty acids with tailored chain length via overexpression of the castor thioesterase RcFatB and the subsequent incorporation of such fatty acids into glycerol backbones shifted the TAG profile in the desired way. Metabolic and nutrient optimization of the engineered bacterial cells resulted in greatly elevated TAG levels (399.4 mg/L) with 43.8% MCFAs, representing the highest TAG levels in E. coli under shake flask conditions. Engineered cells were observed to contain membrane-bound yet robust lipid droplets. We introduced a complete Kennedy pathway into non-oleaginous E . coli towards developing a bacterial platform for the sustainable production of TAGs rich in MCFAs. Strategies reported here illustrate the possibility of prokaryotic cell factories for the efficient production of TAGs rich in MCFAs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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