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Enregistrement W2810407559 · doi:10.17863/cam.30909

A Genome-Wide Association Study of Diabetic Kidney Disease in Subjects With Type 2 Diabetes.

2018· article· en· W2810407559 sur OpenAlexfundno aff
Natalie R. van Zuydam, Emma Ahlqvist, Niina Sandholm, Harshal Deshmukh, N. William Rayner, Moustafa Abdalla, Claes Ladenvall, Daniel Ziemek, Eric B. Fauman, Neil R. Robertson, Paul McKeigue, Erkka Valo, Carol Forsblom, Valma Harjutsalo, Annalisa Perna, Erica Rurali, M. Loredana Marcovecchio, Robert P. Igo, Rany M. Salem, Norberto Perico, Maria Lajer, Minako Imamura, Michiaki Kubo, Atsushi Takahashi, Xueling Sim, Jianjun Liu, Rob M. van Dam, Guozhi Jiang, Claudia H. T. Tam, Andrea O. Y. Luk, Heung Man Lee, Cadmon K.P. Lim, Cheuk‐Chun Szeto, Wing Yee So, Juliana C.N. Chan, Su Fen Ang, Rajkumar Dorajoo, Ling Wang, Tan Si Hua Clara, Amy Jayne McKnight, Seamus Duffy, Marcus G. Pezzolesi, Michel Marre, Beata Gyorgy, Samy Hadjadj, Linda T. Hiraki, Tarunveer S. Ahluwalia, Peter Almgren, Christina‐Alexandra Schulz, Marju Orho‐Melander, Allan Linneberg, Cramer Christensen, Daniel R. Witte, Niels Grarup, Ivan Brandslund, Olle Melander, Andrew D. Paterson, David‐Alexandre Trégouët, Alexander P. Maxwell, Su Chi Lim, E Shyong Tai, Shiro Maeda, Valeriya Lyssenko, Andrzej S. Królewski, Stephen S. Rich, Joel N. Hirschhorn, José C. Florez, David B. Dunger, Oluf Pedersen, Torben Hansen, Peter Rossing, Giuseppe Remuzzi, M. Julia Brosnan, Per‐Henrik Groop, Helen M. Colhoun, Leif Groop, Mark I. McCarthy

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthAssociation Diabète Risque VasculaireSkånes universitetssjukhusTurun Yliopistollinen KeskussairaalaNovo Nordisk FondenSamfundet FolkhälsanDirektör Albert Påhlssons StiftelseDiabetesfondenFinska LäkaresällskapetChinese University of Hong KongFood and Health BureauVetenskapsrådetMedical Research CouncilSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöFolkhälsanin TutkimussäätiöUniversità degli Studi di PadovaKnut och Alice Wallenbergs StiftelseNational Medical Research CouncilLunds UniversitetHong Kong GovernmentWilhelm och Else Stockmanns StiftelseMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyEuropean CommissionNovo NordiskNational Institute for Health and Care ResearchWellcome TrustNIHR Cambridge Biomedical Research CentreHelsingin ja Uudenmaan Sairaanhoitopiiri
Mots-clésDiabetes mellitusMedicineType 2 diabetesDiseaseGenome-wide association studyKidney diseaseInternal medicineGeneticsBiologyEndocrinologySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identification of sequence variants robustly associated with predisposition to diabetic kidney disease (DKD) has the potential to provide insights into the pathophysiological mechanisms responsible. We conducted a genome-wide association study (GWAS) of DKD in type 2 diabetes (T2D) using eight complementary dichotomous and quantitative DKD phenotypes: the principal dichotomous analysis involved 5,717 T2D subjects, 3,345 with DKD. Promising association signals were evaluated in up to 26,827 subjects with T2D (12,710 with DKD). A combined T1D+T2D GWAS was performed using complementary data available for subjects with T1D, which, with replication samples, involved up to 40,340 subjects with diabetes (18,582 with DKD). Analysis of specific DKD phenotypes identified a novel signal near GABRR1 (rs9942471, P = 4.5 × 10-8) associated with microalbuminuria in European T2D case subjects. However, no replication of this signal was observed in Asian subjects with T2D or in the equivalent T1D analysis. There was only limited support, in this substantially enlarged analysis, for association at previously reported DKD signals, except for those at UMOD and PRKAG2, both associated with estimated glomerular filtration rate. We conclude that, despite challenges in addressing phenotypic heterogeneity, access to increased sample sizes will continue to provide more robust inference regarding risk variant discovery for DKD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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