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Enregistrement W2810772799 · doi:10.1186/s12915-018-0538-z

Unique sperm haplotypes are associated with phenotypically different sperm subpopulations in Astyanax fish

2018· article· en· W2810772799 sur OpenAlexfundno aff
Richard Borowsky, Alissa Luk, Xinjian He, Rebecca S. Kim

Notice bibliographique

RevueBMC Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesYork UniversityNational Science Foundation
Mots-clésBiologySpermHaplotypeFish <Actinopterygii>GeneticsEvolutionary biologyZoologyGeneGenotypeFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The phenotypes of sperm are generally believed to be under the control of the diploid genotype of the male producing them rather than their own haploid genotypes, because developing spermatids share cytoplasm through intercellular bridges. This sharing is believed to homogenize their content of gene products. However, not all developing spermatids have identical gene products and estimates are that alleles at numerous gene loci are unequally expressed in sperm. This provides scope for the hypothesis that sperm phenotypes might be influenced by their unique haplotypes. Here we test a key prediction of this hypothesis. RESULTS: The haploid hypothesis predicts that phenotypically different sperm subpopulations should be genetically distinct. We tested this by genotyping different sperm subpopulations that were generated by exposing sperm to a chemical dye challenge (Hoechst 33342). Dye treatment caused the cells to swell and tend to clump together. The three subpopulations of sperm we distinguished in flow cytometry corresponded to single cells, and clumps of two or three. Cell clumping in the presence of the dye may reflect variation in cell adhesivity. We found that allelic contents differed among the three populations. Importantly, the subpopulations with clumped sperm cells were significantly enriched in allelic combinations that had previously been observed to have significantly lower transmission success. CONCLUSIONS: We show that at least one sperm phenotype is correlated with its haploid genotype. This supports a broader hypothesis that the haploid genotypes of sperm cells may influence their fitness, with potentially significant implications for the transmission of deleterious alleles or combinations of alleles to their offspring.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,649

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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