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Enregistrement W2810862321 · doi:10.1016/j.ajhg.2018.06.001

De Novo Truncating Mutations in WASF1 Cause Intellectual Disability with Seizures

2018· article· en· W2810862321 sur OpenAlexafffund
Yoko Itō, Keren Carss, Sofia Duarte, Taila Hartley, Boris Keren, Manju A. Kurian, Isabelle Marey, Perinne Charles, Carla Mendonça, Caroline Nava, Rolph Pfundt, Alba Sanchis‐Juan, Hans van Bokhoven, Anthony van Essen, Conny M.A. van Ravenswaaij‐Arts, Timothy J. Aitman, David Bennett, Mark J. Caulfield, Patrick F. Chinnery, Daniel P. Gale, Ania Koziell, Taco W. Kuijpers, Michael Laffan, Eamonn R. Maher, Hugh S. Markus, Nicholas W. Morrell, Willem H. Ouwehand, David J. Perry, F. Lucy Raymond, Irene Roberts, Kenneth G. C. Smith, Adrian J. Thrasher, Hugh Watkins, Catherine Williamson, Geoffrey Woods, Sofie Ashford, John R. Bradley, Debra Fletcher, Tracey Hammerton, Roger James, Nathalie Kingston, Christopher J. Penkett, Kathleen Stirrups, Marijke Veltman, Tim Young, Matthew A. Brown, Emma Clement, John Davis, Eleanor Dewhurst, Helen Dolling, Marie Erwood, Amy Frary, Rachel Linger, Jennifer M. Martin, Sofia Papadia, Karola Rehnström, Hannah Stark, David Allsup, Steve Austin, Tamam Bakchoul, Tadbir K. Bariana, Paula Bolton‐Maggs, Elizabeth Chalmers, Janine Collins, Peter Collins, Wendy N. Erber, Tamara Everington, Rémi Favier, Kathleen Freson, Bruce Furie, Michael Gattens, Johanna Gebhart, Keith Gomez, Daniel Greene, Andreas Greinacher, Paolo Gresele, Daniel Hart, Johan W. M. Heemskerk, Yvonne Henskens, Rashid Kazmi, David Keeling, Anne M. Kelly, Michele P. Lambert, Claire Lentaigne, Ri Liesner, Sarah Mangles, Mary Mathias, Carolyn M. Millar, Andrew Mumford, Paquita Nurden, Jeanette Payne, John Pasi, Kathelijne Peerlinck, Shoshana Revel‐Vilk, Michael Richards, Matthew T. Rondina, Catherine Roughley, Sol Schulman, Harald Schulze, Marie Scully, Suthesh Sivapalaratnam, Matthew Stubbs, R. Campbell Tait, Kate Talks, Jecko Thachil, Cheng‐Hock Toh, Ernest Turro, Chris Van Geet, Minka De Vries, Timothy Q. Warner, Henry G. Watson, Sarah K. Westbury, Abigail Furnell, Rutendo Mapeta, Paula Rayner-Matthews, Ilenia Simeoni, Simon Staines, Jonathan Stephens, Christopher D. Watt, Deborah Whitehorn, Antony Attwood, Louise C. Daugherty, Sri V. V. Deevi, Csaba Halmagyi, Fengyuan Hu, Vera Matser, Stuart Meacham, Karyn Mégy, Olga Shamardina, Catherine Titterton, Salih Tuna, Ping Yu, Julie von Ziegenweldt, William J. Astle, Marta Bleda, Stefan Gräf, Matthias Haimel, Hana Lango Allen, Sylvia Richardson, Paul Calleja, Stuart Rankin, Wojciech Turek, Julie Anderson, Christine Bryson, Jenny Carmichael, Coleen McJannet, Sophie Stock, Louise Allen, Gautum Ambegaonkar, Ruth Armstrong, Gavin Arno, Maria Bitner‐Glindzicz, Angie Brady, Natalie Canham, Manali Chitre, Virginia Clowes, Patrick Deegan, Charu Deshpande, Rainer Döffinger, Helen V. Firth, Frances Flinter, Courtney E. French, Alice Gardham, Neeti Ghali, Paul Gissen, Detelina Grozeva, Robert Henderson, Anke Hensiek, Simon Holden, Muriel Holder, Susan Holder, Jane A. Hurst, Dragana Josifova, Deepa Krishnakumar, Melissa Lees, Robert E. MacLaren, Anna Maw, Sarju Mehta, Michel Michaelides, Anthony T. Moore, Elaine Murphy, Soo‐Mi Park, Alasdair Parker, C. Patch, Joan Paterson, Julia Rankin, Evan Reid, Elisabeth Rosser, Richard Sandford, Saikat Santra, Richard H. Scott, Aman Sohal, Penelope E. Stein, Ellen Thomas, Dorothy Thompson, Marc Tischkowitz, Julie Vogt, Emma Wakeling, Evangeline Wassmer, Andrew R. Webster, Sonia Ali, Souad Ali, Harm Boggard, Colin Church, Gerry Coghlan, Victoria Cookson, Paul A. Corris, Amanda Creaser-Myers, Rosa DaCosta, Natalie Dormand, Mélanie Eyries, Henning Gall, Pavandeep Ghataorhe, Stefano Ghio, J. Simon R. Gibbs, Barbara Girerd, Alan Greenhalgh, Charaka Hadinnapola, Arjan C. Houweling, Marc Humbert, Anna Huis in’t Veld, Fiona Kennedy, David G. Kiely, Gábor Kovács, Allan Lawrie, Rob V. Mackenzie Ross, Rajiv D. Machado, Larahmie Masati, Sharon Meehan, Shahin Moledina, David Montani, Shokri Othman, Andrew J. Peacock, Joanna Pepke‐Żaba, Val Pollock, Gary Polwarth, Lavanya Ranganathan, Christopher J. Rhodes, Kévin Rue-Albrecht, Gwen Schotte, Debbie Shipley, Florent Soubrier, Laura Southgate, Laura Scelsi, Jay Suntharalingam, Yvonne Tan, Mark Toshner, Carmen Treacy, Richard C. Trembath, Anton Vonk Noordegraaf, Sara E. Walker, Ivy Wanjiku, John Wharton, Martin R. Wilkins, Stephen J. Wort, Katherine Yates, Hana Alachkar, Richard Antrobus, Gururaj Arumugakani, Chiara Bacchelli, Helen Baxendale, Claire Bethune, Shahnaz Bibi, Claire Booth, Michael J. Browning, Siobhan O. Burns, Anita Chandra, Nichola Cooper, Sophie Davies, Lisa Devlin, Elizabeth Drewe, David Edgar, William Egner, Rohit Ghurye, Sarah Goddard, Pavel Gordins, Sofia Grigoriadou, Scott Hackett, Rosie Hague, Lorraine Harper, Grant Hayman, Archana Herwadkar, Aarnoud Huissoon, Stephen Jolles, Peter Kelleher, Dinakantha Kumararatne, Sara Lear, Hilary Longhurst, Lorena Lorenzo, Jesmeen Maimaris, Ania Manson, Elizabeth McDermott, Sai Murng, Sergey Nejentsev, Sadia Noorani, Eric Oksenhendler, Mark Ponsford, Waseem Qasim, Isabella Quinti, Alex Richter, Crina Samarghitean, Ravishankar Sargur, Sinisa Savic, Suranjith L. Seneviratne, Carrock Sewell, Emily Staples, Hans J. Stauss, James Thaventhiran, Moira Thomas, Steve Welch, Lisa Willcocks, Nigel Yeatman, Patrick Yong, Phil Ancliff, Christian Babbs, Mark Layton, Eleni Louka, Simon J. McGowan, Adam J. Mead, Noémi Roy, Jenny Chambers, Peter Dixon, Cecelia Estiu, Bill Hague, Hanns–Ulrich Marschall, Michael A. Simpson, Sam Chong, Ingrid Emmerson, Lionel Ginsberg, David Gosal, Robert D. M. Hadden, Rita Horváth, Mohamed Mahdi-Rogers, Adnan Manzur, Andrew Marshall, Emma Matthews, Mark I. McCarthy, Mary Reilly, Tara Renton, Andrew J. Rice, Andreas C. Themistocleous, Tom Vale, Natalie Van Zuydam, Suellen M. Walker, Elizabeth Ormondroyd, Gavin Hudson, Wei Wei, Patrick Yu Wai Man, James W. Whitworth, Maryam Afzal, Elizabeth Colby, Moin A. Saleem, Omid S. Alavijeh, H. Terry Cook, Sally Johnson, Adam P. Levine, Edwin Wong, Rhea Tan, Kym M. Boycott, Alex MacKenzie, Jacek Majewski, Michael Brudno, Dennis E. Bulman, David A. Dyment, Kristin D. Kernohan, Sarah Dyack

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioDalhousie UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNIHR BioResourceRosetrees TrustNIHR Cambridge Biomedical Research CentreBritish Heart FoundationCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario GenomicsNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilOntario Genomics Institute
Mots-clésIntellectual disabilityGeneticsEpilepsyPsychologyMedicinePsychiatryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Next-generation sequencing has been invaluable in the elucidation of the genetic etiology of many subtypes of intellectual disability in recent years. Here, using exome sequencing and whole-genome sequencing, we identified three de novo truncating mutations in WAS protein family member 1 (WASF1) in five unrelated individuals with moderate to profound intellectual disability with autistic features and seizures. WASF1, also known as WAVE1, is part of the WAVE complex and acts as a mediator between Rac-GTPase and actin to induce actin polymerization. The three mutations connected by Matchmaker Exchange were c.1516C>T (p.Arg506Ter), which occurs in three unrelated individuals, c.1558C>T (p.Gln520Ter), and c.1482delinsGCCAGG (p.Ile494MetfsTer23). All three variants are predicted to partially or fully disrupt the C-terminal actin-binding WCA domain. Functional studies using fibroblast cells from two affected individuals with the c.1516C>T mutation showed a truncated WASF1 and a defect in actin remodeling. This study provides evidence that de novo heterozygous mutations in WASF1 cause a rare form of intellectual disability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,637
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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