MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2811013421 · doi:10.1017/cjn.2018.173

P.071 Novel mutations in SPG7 identified from patients with late-onset spasticity

2018· article· en· W2811013421 sur OpenAlexaffvenue
Momen Almomen, K. A. Martens, Averill Hanson, Lawrence Korngut, Gerald Pfeffer

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensCalgary Laboratory Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHereditary spastic paraplegiaAtaxiaTrinucleotide repeat expansionCerebellar ataxiaExome sequencingMedicineFrataxinMutationGenetic testingGeneticsSpinocerebellar ataxiaBiologyPathologyPhenotypeGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Hereditary spastic paraplegia (HSP) is a group of genetic diseases that cause progressive degeneration of the corticospinal tract. Historically, this disease was divided into two types:the classic subtype, with leg weakness and hypertonic bladder, and the complicated subtype, with features such as cerebellar ataxia or optic atrophy.Mutations in SPG7 ( encoding paraplegin) leads to complicated HSP causing cerebellar ataxia, progressive external ophthalmoplegia in addition to the classical symptoms. AFG3L2 is a binding partner of paraplegin and mutations in AFG3L2 cause a similar syndrome Methods: From a neurogenetic clinic , we identified 11 patients with late-onset HSP. Sequencing of SPG7 and AFG3L2 was performed using a customised assay, and/or clinical diagnostic sequencing panels. SPG7 transcript level quantification was performed from whole blood RNA on a digital droplet qPCR system. Results: We identified 4 patients with pathogenic variants or variants of unknown significance in SPG7 . No AFG3L2 mutations were identified. We provide evidence for pathogenicity for three mutations that were not previously associated with SPG7-related disease, based on their occurrence in context of the correct phenotype, and the reduction of transcript levels measured with RT-qPCR.A curious association of the heterozygous p.Gly349Ser mutation in association with an ALS-like syndrome is reported. Conclusions: SPG7 mutations sequencing has high diagnostic yield in late onset paraparesis

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesÉtudes des sciences et des technologies
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0030,015
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0030,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences NeurologiquesMême sujetHereditary Neurological DisordersTravaux en français237 207