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Enregistrement W2811072941 · doi:10.1080/13816810.2018.1466337

Clinical and genetic features of eight Chinese autosomal-dominant optic atrophy pedigrees with six novel<i>OPA1</i>pathogenic variants

2018· article· en· W2811072941 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueOphthalmic Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Eye InstituteNatural Science Foundation of Beijing MunicipalityNational Natural Science Foundation of ChinaMinistry of Science and Technology of the People's Republic of ChinaFoundation Fighting Blindness
Mots-clésGenBankSanger sequencingGeneticsExonRNA splicingBiologyPedigree chartMinigeneIntronExomeExome sequencingMolecular biologyGeneDNA sequencingAlternative splicingMutationRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Autosomal-dominant optic atrophy (ADOA) is one of the most common types of inherited optic atrophy. We identify OPA1 pathogenic variants and assess the clinical features of a cohort of Chinese ADOA patients Materials and Methods: Detailed clinical evaluations were performed and genomic DNA was extracted from peripheral blood for all the participants. Sanger sequencing was used to analyze all exons and exon/intron junctions of OPA1 for eight pedigrees. Target exome capture plus next-generation sequencing (NGS) were applied for one atypical family with photophobia. Reverse transcription polymerase chain reaction was carried out to further characterize the mRNA change of selected splicing alteration. RESULTS: All 17 patients had impaired vision and optic-disk pallor; however, the clinical severity varied markedly. Two patients complicated with hearing loss. Six novel and two reported pathogenic variants in OPA1 (GenBank Accession No. NM_130837.2) were identified including four nonsynonymous variants (c.2400T > G, c.1468T > C, c.1567A > G and c.1466T > C), two splicing variants (c.2984-1_2986delGAGA and c.2983 + 5G > A), one small deletion (c.2960_2968delGCGTTCAAC), and one small insertion (c.3009_3010insA). RNA analysis revealed the splicing variant c.2984-1_2986delGAGA caused small deletion of mRNA (r.2983_2988del). CONCLUSIONS: ADOA patients presented variable clinical manifestations. Novel OPA1 pathogenic variants are the main genetic defect for Chinese ADOA cases. NGS may be a useful molecular testing tool for atypical ADOA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,837
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle