Abstract PL04-04: Oncohistones in cancer: How to turn a cell's symphony into non harmonic rap
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Recent studies have shown that chromatin-associated proteins and transcription factors have more somatic alterations than any other class of oncoproteins in childhood CNS tumors. Different Histone H3 genes (H3F3A, Hist3.1B) and variants (K27, G34, K36) can be affected with remarkable specific association between tumor location and type as well as the particular H3 residue or variant that is mutated. We have shown a high prevalence of H3 mutations in pediatric and young adult High Grade Astrocytoma, in sarcomas such as Giant Cell Tumors of the bone and chondroblastomas, and most recently, in Head and Neck Squamous Cell Carcinomas. These ground-breaking discoveries of oncohistones implicate a direct effect of epigenetic misregulation in oncogenesis. Here, we describe these epigenetic misfits and our knowledge of their effects, along with novel tools needed to study them. We will also discuss how we are harnessing synergies between the approaches of cancer genomics and chemical biology to help make sense of the pathogenesis of oncohistones and describe how oncohistones are promoting global redistribution of important epigenetic marks, seemingly hijacking our epigenome. Citation Format: Nada Jabado. Oncohistones in cancer: How to turn a cell's symphony into non harmonic rap [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr PL04-04.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,019 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».