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Enregistrement W2811189142 · doi:10.7554/elife.36354

Nanoscale dysregulation of collagen structure-function disrupts mechano-homeostasis and mediates pulmonary fibrosis

2018· article· en· W2811189142 sur OpenAlexafffund
Mark G. Jones, Orestis G. Andriotis, James Roberts, Kerry Lunn, Victoria Tear, Lucy Cao, Kjetil Ask, David E. Smart, Alessandra Bonfanti, Peter Johnson, Aiman Alzetani, Franco Conforti, Regan Doherty, Chester Lai, Benjamin C. Johnson, Konstantinos N. Bourdakos, Sophie Fletcher, Ben G. Marshall, Sanjay Jogai, Christopher J. Brereton, Serena Chee, Christian H. Ottensmeier, Patricia J. Sime, Jack Gauldie, Martin Kolb, Sumeet Mahajan, Aurélie Fabre, Atul Bhaskar, Wolfgang Jarolimek, Luca Richeldi, Katherine Ma O’Reilly, Phillip Monk, Philipp J. Thurner, Donna E. Davies

Notice bibliographique

RevueeLife · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial metabolism and enzyme function
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilMedical Research FoundationMedical Research CouncilWellcomeBritish Lung FoundationEngineering and Physical Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of AberdeenUniversity Hospital Southampton NHS Foundation TrustWellcome Trust
Mots-clésExtracellular matrixFibrosisHomeostasisLysyl oxidaseCell biologyMechanosensitive channelsChemistryElastinCollagen VIFibrillogenesisPulmonary fibrosisPathologyBiologyMedicineFibrilBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matrix stiffening with downstream activation of mechanosensitive pathways is strongly implicated in progressive fibrosis; however, pathologic changes in extracellular matrix (ECM) that initiate mechano-homeostasis dysregulation are not defined in human disease. By integrated multiscale biomechanical and biological analyses of idiopathic pulmonary fibrosis lung tissue, we identify that increased tissue stiffness is a function of dysregulated post-translational collagen cross-linking rather than any collagen concentration increase whilst at the nanometre-scale collagen fibrils are structurally and functionally abnormal with increased stiffness, reduced swelling ratio, and reduced diameter. In ex vivo and animal models of lung fibrosis, dual inhibition of lysyl oxidase-like (LOXL) 2 and LOXL3 was sufficient to normalise collagen fibrillogenesis, reduce tissue stiffness, and improve lung function in vivo. Thus, in human fibrosis, altered collagen architecture is a key determinant of abnormal ECM structure-function, and inhibition of pyridinoline cross-linking can maintain mechano-homeostasis to limit the self-sustaining effects of ECM on progressive fibrosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations170
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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