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Enregistrement W2811360205 · doi:10.1017/cjn.2018.236

P.134 Infantile Onset Multisystem Neurologic, Endocrine and Pancreatic Disease: case series and review

2018· article· en· W2811360205 sur OpenAlexvenueaboutno aff
Cat Anh Le, AN Prasad, Derek Debicki, A Andrade, AC Rupar, Charushree Prasad

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationNonsense mutationGeneticsMutationFrameshift mutationMedicineStop codonBiologyExonExome sequencingBioinformaticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: We report three brothers born to consanguineous parents of Syrian descent with a novel homozygous c.324G>A (p.W108*) mutation in PTRH2 that encodes mitochondrial peptidyl-tRNA hydrolase 2. Mutations in PTRH2 have recently been identified in the autosomal recessive condition, Infantile Onset Multisystem Neurologic, Endocrine and Pancreatic Disease (IMNEPD). To our knowledge, this is the first case of IMNEPD described in a Canadian centre. Methods: Clinical phenotyping enabled a targeted approach in which all exons of PTRH2 were sequenced. We identified a novel mutation and compared our patients with those recently described. Results: We identified a homozygous nonsense mutation in PTRH2, c.324G>A (p.W108*). This G to A mutation results in a premature stop at codon 108 that produces a truncated protein, removing most of the amino acids at the enzymatic active site. This mutation is not listed in the human Gene Mutation Database Cardiff, NCBI dbSNP, 1000 Genomes, Exome Variant Server or ClinVar and is a rare variant listed in gnomAD. Conclusions: In IMNEPD, nonsense mutations in PTRH2 appear to cause severe disease with postnatal microcephaly, neurodevelopmental regression, and ataxia with additional features of seizures, peripheral neuropathy, and pancreatic dysfunction, whereas missense mutations may produce a milder phenotype. The spectrum exhibited by our patients suggests variable expressivity with PTRH2 mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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