Introduction to the SAVE study (2011–15): Streptococcus pneumoniae serotyping and antimicrobial susceptibility: Assessment for Vaccine Efficacy in Canada after the introduction of PCV-13
Notice bibliographique
Résumé
Streptococcus pneumoniae continues to be an important bacterial pathogen associated with invasive (e.g. bacteraemia) and non-invasive (e.g. community-acquired respiratory tract) infections worldwide. Surveillance studies conducted nationally and globally can assist in determining trends across geographical areas and allow comparisons between countries. SAVE is an ongoing, annual, national study focused on characterizing invasive isolates of S. pneumoniae obtained across Canada. This Supplement documents the initial 5 years of the SAVE study (2011-15) during which 6207 invasive isolates of S. pneumoniae were evaluated. The three manuscripts in this Supplement provide a comprehensive examination of the changing patterns of invasive S. pneumoniae obtained across Canada over a 5 year period. The data highlight the evolution of S. pneumoniae antimicrobial resistance and multidrug resistance, serotype distribution, genotypic relatedness and virulence under pressure by vaccination and antimicrobial usage. This allows both clinicians and researchers nationally and globally to view the current status of invasive pneumococcal infections in Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,017 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».