Interaction via the N terminus of the type IV secretion system (T4SS) protein VirB6 with VirB10 is required for VirB2 and VirB5 incorporation into T-pili and for T4SS function
Notice bibliographique
Résumé
Many bacterial pathogens employ multicomponent protein complexes such as type IV secretion systems (T4SSs) to transfer virulence factors into host cells. Here we studied the interaction between two essential T4SS components: the very hydrophobic inner membrane protein VirB6, which may be a component of the translocation channel, and VirB10, which links the inner and outer bacterial membranes. To map the interaction site between these two T4SS components, we conducted alanine scanning and deleted six-amino acid stretches from the N-terminal periplasmic domain of VirB6 from Brucella suis . Using the bacterial two-hybrid system to analyze the effects of these alterations on the VirB6–VirB10 interaction, we identified the amino acid regions 16–21 and 28–33 and Leu-18 in VirB6 as being required for this interaction. SDS-PAGE coupled with Western blotting of cell lysates and native PAGE of detergent-extracted membrane proteins revealed that the corresponding VirB6 residues in Agrobacterium tumefaciens (Phe-20 and amino acids 18–23 and 30–35) modulate the stability of both VirB6 and VirB5. However, the results from immuno-EM and super-resolution microscopy suggested that these regions and residues are not required for membrane association or for polar localization of VirB6. The six-amino acid deletions in the N terminus of VirB6 abolished pilus formation and virulence of A. tumefaciens , and the corresponding deletions in the VirB6 homolog TraD from the plasmid pKM101-T4SS abrogated plasmid transfer. Our results indicate that specific residues of the VirB6 N-terminal domain are required for VirB6 stabilization, its interaction with VirB10, and the incorporation of VirB2 and VirB5 into T-pili.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».